這周的文獻分享，jw給大家講解了一篇和治療相關(guān)的單細胞文獻蚜锨，內(nèi)容為：乳腺癌患者經(jīng)過anti-PD1治療后档插，腫瘤內(nèi)變化的單細胞圖譜。
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講解很細致亚再，大家可以移步B站學(xué)習(xí)郭膛。
下文結(jié)合jw的講解和原文內(nèi)容，簡單介紹一下
背景
前期相關(guān)研究已經(jīng)表明针余，乳腺癌患者接受免疫治療后饲鄙，整體上可以得到一定緩解和延長生存。盡管如此圆雁，還是有一部分人沒有響應(yīng)忍级。
是否有一些潛在機制或者標(biāo)志物可以預(yù)測治療響應(yīng)，顯得十分重要伪朽，這也是這篇文章的目的轴咱。PD1、PD-L1烈涮、淋巴細胞浸潤朴肺、TMB等等這些都是已知的標(biāo)志物，此外T細胞克隆擴增也能預(yù)示著ICB的治療響應(yīng)坚洽。這篇文章也是以此為出發(fā)點展開的課題戈稿。
實驗設(shè)計
取anti-PD1治療前后的配對樣本，同時進行scRNA-seq和scTCR-seq讶舰。根據(jù)T細胞的克隆型將病人分成了克隆擴增(E)和沒有克隆擴增(NE)兩組鞍盗。
結(jié)果
文章的很多結(jié)果都是在治療前/治療后需了，E / NE這樣的分組之間進行比較。
作者將同時具有激活般甲、耗竭特征的T細胞命名為Tex cells(experienced T cells)肋乍。這類細胞有增殖特征，表達PD1分子敷存，且E組比NE組更高墓造。從細胞占比來看，這類細胞在E組也更多锚烦。
這些數(shù)據(jù)表明：表達PD1的T細胞百分比和T細胞克隆擴增相關(guān)觅闽，在anti-PD1治療后，CD8+和CD4+的Tex細胞是主要的擴增T細胞挽牢。
擬時序分析發(fā)現(xiàn)谱煤，在naive T向CD8+ Tex細胞轉(zhuǎn)變的路徑后期，來自E組的Tex細胞比NE組更多禽拔。
CD4 T細胞進行了類似的分析刘离，發(fā)現(xiàn)在naive T向CD4 Tfh以及CD4 Th1細胞轉(zhuǎn)變的路徑后期，來自E組的細胞比NE組更多睹栖。
結(jié)合上面兩個內(nèi)容硫惕，作者認為CD4 Tfh和CD4 Th1支持了CD8+ Tex的功能
接著探究了一下，是否存在一個signature可用于預(yù)測T細胞的克隆擴增野来。
對DC細胞的分析表明恼除，DC細胞具有免疫響應(yīng)的特征，可以支持T細胞的功能曼氛。
緊接著對巨噬細胞豁辉、腫瘤細胞進行分析...
然后是細胞通訊分析...
總結(jié)與討論
- 課題系統(tǒng)評估了經(jīng)ICB治療后，乳腺癌患者的腫瘤內(nèi)細胞和分子層面的變化舀患；
- 乳腺癌患者在接受anti-PD1治療后徽级，是否有一些標(biāo)志物可以預(yù)測T細胞克隆擴增？作者在pre-treatment的免疫微環(huán)境中聊浅，找到了一些特征餐抢。
講得很棒，我也就聽了3遍吧~
