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[隨筆]minimap2 節(jié)約內(nèi)存
minimap2 我是用10G 以上基因組 +100G reads 默認(rèn)參數(shù)下一般消耗20-40G 內(nèi)存课竣；存入文件時消耗80G 后來思考，-I 參數(shù)，對于一些大基因組 ...
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我已經(jīng)跑了orthofinder得到了orthologs尚胞，每個基因文件里都是蛋白序列，我怎么得到每個基因包含所有物種的核酸序列呢帜慢？
從參考基因組(序列)和SNPs(位點(diǎn))入手的Ka/Ks（dN/dS）選擇分析的基本思路流程
Update Mar 9, 2023: 多物種尋找orthologs可以用OrthoFinder： https://github.com/davidemms/OrthoFin...
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個人博客: xuzhougeng.top (隨緣訪問)
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@hayes_L 你好！請問juicer2產(chǎn)生的文件里沒有merged_nodups.txt抽减，而是merged_dehup.bam和merged*.txt文件允青，應(yīng)該如何生成merged_nohups.txt文件來作為3d-dna的輸入mnd文件？
利用Juicer v2.0掛載染色體
最近在搞基因組卵沉，前面contig的組裝難度不大颠锉，用wtdbg2法牲、raven、mecat2琼掠、flye等組裝就可以了拒垃。 組裝完畢后，contig掛載成染色體瓷蛙，可以采用高密度遺傳連...
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Centos7安裝艰猬，常用命令横堡，軟件環(huán)境部署。
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請問第4步怎么檢查?能寫詳細(xì)點(diǎn)嗎冠桃？
CentOS7 開機(jī)無法進(jìn)入圖形登陸界面
問題：CentOS 7.3圖形界面開機(jī)一直卡在該界面翅萤，無法進(jìn)入登錄界面。 解決方案： 1.開機(jī)后等待到下圖界面腊满，按上下鍵方向鍵停留在該界面 2. 選中第一項(xiàng)，按“e”進(jìn)入編輯...
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本號停更
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一條小咸魚
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中科院博士 Candidate<br>生信小白<br>殺蟲狂魔<br>微信公眾號:顫抖吧小蟲子
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PhD student in Biology | Genomics | Evolution | TSS | python | R | Machine Learning | R package develop<br>
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周運(yùn)來落包，男，長大了才會遇到的帥哥摊唇，穩(wěn)健咐蝇，瀟灑，大方巷查，靠譜有序。一段生信緣抹腿，一棵技能樹。生信技能樹核心成員笔呀，單細(xì)胞天地供稿人幢踏，簡書創(chuàng)作者，單細(xì)胞數(shù)據(jù)科學(xué)家许师。
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你好房蝉，可以把你的數(shù)據(jù)格式發(fā)出來嗎？我照著你的代碼試?yán)蠄箦e
8. 群落結(jié)構(gòu)差異顯著性
非參數(shù)置換的多變量方差分析(ANONIS)微渠、相似性分析(ANOSIM)和多反應(yīng)置換法(MRPP)常被用來評估不同采樣點(diǎn)之間微生物群落組成差異的顯著性搭幻。 一般來說，當(dāng)我們通過降...
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宏基因組和16s的相關(guān)分析流程俯逾、方法、所用工具
