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[隨筆]minimap2 節(jié)約內存
minimap2 我是用10G 以上基因組 +100G reads 默認參數下一般消耗20-40G 內存羞海；存入文件時消耗80G 后來思考，-I 參數够坐，對于一些大基因組 ...
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我已經跑了orthofinder得到了orthologs茫虽，每個基因文件里都是蛋白序列，我怎么得到每個基因包含所有物種的核酸序列呢既们？
從參考基因組(序列)和SNPs(位點)入手的Ka/Ks（dN/dS）選擇分析的基本思路流程
Update Mar 9, 2023: 多物種尋找orthologs可以用OrthoFinder： https://github.com/davidemms/OrthoFin...
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個人博客: xuzhougeng.top (隨緣訪問)
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@hayes_L 你好！請問juicer2產生的文件里沒有merged_nodups.txt斯棒，而是merged_dehup.bam和merged*.txt文件盾致，應該如何生成merged_nohups.txt文件來作為3d-dna的輸入mnd文件？
利用Juicer v2.0掛載染色體
最近在搞基因組荣暮，前面contig的組裝難度不大庭惜，用wtdbg2、raven穗酥、mecat2护赊、flye等組裝就可以了。 組裝完畢后砾跃，contig掛載成染色體百揭，可以采用高密度遺傳連...
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Centos7安裝器一，常用命令，軟件環(huán)境部署厨内。
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請問第4步怎么檢查?能寫詳細點嗎祈秕？
CentOS7 開機無法進入圖形登陸界面
問題：CentOS 7.3圖形界面開機一直卡在該界面渺贤，無法進入登錄界面。 解決方案： 1.開機后等待到下圖界面请毛，按上下鍵方向鍵停留在該界面 2. 選中第一項志鞍，按“e”進入編輯...
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本號停更
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一條小咸魚
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中科院博士 Candidate<br>生信小白<br>殺蟲狂魔<br>微信公眾號:顫抖吧小蟲子
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PhD student in Biology | Genomics | Evolution | TSS | python | R | Machine Learning | R package develop<br>
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周運來斤程，男角寸，長大了才會遇到的帥哥，穩(wěn)健暖释，瀟灑袭厂，大方，靠譜球匕。一段生信緣纹磺，一棵技能樹。生信技能樹核心成員亮曹，單細胞天地供稿人橄杨，簡書創(chuàng)作者，單細胞數據科學家照卦。
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你好式矫，可以把你的數據格式發(fā)出來嗎？我照著你的代碼試老報錯
8. 群落結構差異顯著性
非參數置換的多變量方差分析(ANONIS)役耕、相似性分析(ANOSIM)和多反應置換法(MRPP)常被用來評估不同采樣點之間微生物群落組成差異的顯著性采转。 一般來說，當我們通過降...
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宏基因組和16s的相關分析流程察绷、方法干签、所用工具
