IP屬地：湖南
-
-
Counts FPKM RPKM TPM CPM 的轉(zhuǎn)化
一、什么是RPKM总寻、 FPKM器罐、TPM、CPM RPKM, FPKM and TPM, clearly explained - StatQuest!!
2023-07-21使用Trinity進行轉(zhuǎn)錄組De novo組裝(無參)軟件安裝與下載 運行數(shù)據(jù) 功能注釋 組裝后的文件就是轉(zhuǎn)錄本文件在未消除樣品之間的差異之前渐行，用TPM來比較勉強可以轰坊，但是FPKM不行。
-
轉(zhuǎn)錄組分析——STAR+RSEM+Deseq2STAR+RSEM+Deseq2視頻課程鏈接已經(jīng)公開, https://www.bilibili.com/video/BV1KJ411p7WN?p=8[https://www...
-
-
orthofinder安裝及使用教程安裝orthofinder 使用conda安裝 安裝軟件前，先設(shè)置一個小環(huán)境蕴忆，不要直接在自己賬戶的當(dāng)前環(huán)境內(nèi)安裝軟件颤芬；你可以創(chuàng)建很多小環(huán)境名，有的小環(huán)境壞了，你不要就可以了...
-
-
中科院研究生在讀留荔，努力學(xué)習(xí)中
-
-
小弟讀過兩年書肥隆，塵世中一個迷途小書僮<br><br>歡迎訪問: <a href="https://links.jianshu.com/go?to=https%3A%2F%2Fthereallda.github.io%2F" target="_blank">https://thereallda.github.io/</a>
-
理論 | edgeR -- TMM normalization 詳細計算過程
最近在看差異分析當(dāng)中原始read counts是如何被校正的既荚，自然就不會放過差異分析的經(jīng)典之一 —— edgeR. edgeR使用的校正方法稱為trimmed mean of...
-
張紅祥恰聘，中國科學(xué)院植物研究所。<br>交流吸占，分享晴叨。
-
基于重測序數(shù)據(jù)計算 iHS 選擇信號
Integrated Haplotype Score (iHS) (Voight et al., 2006) 是基于單倍型的選擇信號檢測軟件。iHS 通過比較單倍型頻率的衰減...
-
很多帖子被下架了。以后開直播帶貨吧件蚕。寫不動技術(shù)貼了孙技。
-
SIFT4G:預(yù)測氨基酸取代是否會影響蛋白質(zhì)功能
SIFT4G[https://sift.bii.a-star.edu.sg/sift4g/Commandline.html] 使用方法：1.下載對應(yīng)物種的SIFT數(shù)據(jù)庫htt...
-
每日paper - 20220216 - Review - 基于基因組數(shù)據(jù)的遺傳負荷研究Genetic load: genomic estimates and applications in non-model animals[https://www.natur...
-
宏基因組學(xué)/群體遺傳學(xué) 方向
-
生信 | Circos的安裝寫在前面的碎碎念 最近在嘗試Cricos這款優(yōu)秀的可視化軟件牵啦，但是在安裝的時候有一些問題，記錄一下妄痪。首先我是conda的忠實用戶哈雏，因此下載軟件的第一反應(yīng)就是去Bioconda...
-
生信 | Circos實戰(zhàn)寫在前面 由于circos官網(wǎng)的教程太全面了，雖然好但反而感覺比較復(fù)雜衫生，難易上手裳瘪，因此我將他們精簡了一下。由于官網(wǎng)的教程中包含的數(shù)據(jù)太雜了罪针，所以我精簡了數(shù)據(jù)與代碼放到了扣扣群...
-
TBtools | 全基因組 - 基因密度統(tǒng)計彭羹，充實你的圖片摘要 兩張圖總結(jié)本文，以方便大家確定是否還有看下去的興趣 寫在前面 Emmm... 今天開放一個舊功能站故，全基因組基因密度統(tǒng)計皆怕。雖然是早前就寫好的毅舆，但我一直沒開放，主要是考慮到...
