IP屬地：安徽
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Counts FPKM RPKM TPM CPM 的轉(zhuǎn)化
一拇砰、什么是RPKM诗良、 FPKM、TPM昨悼、CPM RPKM, FPKM and TPM, clearly explained - StatQuest!!
2023-07-21使用Trinity進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組De novo組裝(無(wú)參)軟件安裝與下載 運(yùn)行數(shù)據(jù) 功能注釋 組裝后的文件就是轉(zhuǎn)錄本文件在未消除樣品之間的差異之前捉腥，用TPM來(lái)比較勉強(qiáng)可以，但是FPKM不行何陆。
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轉(zhuǎn)錄組分析——STAR+RSEM+Deseq2STAR+RSEM+Deseq2視頻課程鏈接已經(jīng)公開(kāi), https://www.bilibili.com/video/BV1KJ411p7WN?p=8[https://www...
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orthofinder安裝及使用教程安裝orthofinder 使用conda安裝 安裝軟件前贷盲，先設(shè)置一個(gè)小環(huán)境淘这，不要直接在自己賬戶的當(dāng)前環(huán)境內(nèi)安裝軟件；你可以創(chuàng)建很多小環(huán)境名巩剖，有的小環(huán)境壞了铝穷，你不要就可以了...
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中科院研究生在讀鞠鲜，努力學(xué)習(xí)中
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小弟讀過(guò)兩年書(shū)并思，塵世中一個(gè)迷途小書(shū)僮<br><br>歡迎訪問(wèn): <a href="https://links.jianshu.com/go?to=https%3A%2F%2Fthereallda.github.io%2F" target="_blank">https://thereallda.github.io/</a>
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理論 | edgeR -- TMM normalization 詳細(xì)計(jì)算過(guò)程
最近在看差異分析當(dāng)中原始read counts是如何被校正的，自然就不會(huì)放過(guò)差異分析的經(jīng)典之一 —— edgeR. edgeR使用的校正方法稱為trimmed mean of...
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張紅祥，中國(guó)科學(xué)院植物研究所仙畦。<br>交流输涕，分享。
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基于重測(cè)序數(shù)據(jù)計(jì)算 iHS 選擇信號(hào)
Integrated Haplotype Score (iHS) (Voight et al., 2006) 是基于單倍型的選擇信號(hào)檢測(cè)軟件慨畸。iHS 通過(guò)比較單倍型頻率的衰減...
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很多帖子被下架了寸士。以后開(kāi)直播帶貨吧檐什。寫(xiě)不動(dòng)技術(shù)貼了。
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SIFT4G:預(yù)測(cè)氨基酸取代是否會(huì)影響蛋白質(zhì)功能
SIFT4G[https://sift.bii.a-star.edu.sg/sift4g/Commandline.html] 使用方法：1.下載對(duì)應(yīng)物種的SIFT數(shù)據(jù)庫(kù)htt...
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每日paper - 20220216 - Review - 基于基因組數(shù)據(jù)的遺傳負(fù)荷研究Genetic load: genomic estimates and applications in non-model animals[https://www.natur...
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宏基因組學(xué)/群體遺傳學(xué) 方向
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生信 | Circos的安裝寫(xiě)在前面的碎碎念 最近在嘗試Cricos這款優(yōu)秀的可視化軟件，但是在安裝的時(shí)候有一些問(wèn)題婶博，記錄一下瓮具。首先我是conda的忠實(shí)用戶，因此下載軟件的第一反應(yīng)就是去Bioconda...
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生信 | Circos實(shí)戰(zhàn)寫(xiě)在前面 由于circos官網(wǎng)的教程太全面了凡人，雖然好但反而感覺(jué)比較復(fù)雜名党，難易上手，因此我將他們精簡(jiǎn)了一下挠轴。由于官網(wǎng)的教程中包含的數(shù)據(jù)太雜了传睹，所以我精簡(jiǎn)了數(shù)據(jù)與代碼放到了扣扣群...
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TBtools | 全基因組 - 基因密度統(tǒng)計(jì)，充實(shí)你的圖片摘要 兩張圖總結(jié)本文岸晦，以方便大家確定是否還有看下去的興趣 寫(xiě)在前面 Emmm... 今天開(kāi)放一個(gè)舊功能欧啤，全基因組基因密度統(tǒng)計(jì)。雖然是早前就寫(xiě)好的委煤，但我一直沒(méi)開(kāi)放堂油，主要是考慮到...
