發(fā)簡(jiǎn)信
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「生信」共線性分析——MCScanX目錄MCScanX下載及安裝數(shù)據(jù)準(zhǔn)備MCScanX運(yùn)行及結(jié)果Ka & Ks 計(jì)算下游畫圖腳本最后 MCScanX有兩個(gè)主要的功能, 一是, 方便使用者發(fā)現(xiàn)共線性(collin...
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非模式物種的GO/KEGG注釋對(duì)于非模式物種，需要做GO或KEGG富集古沥，可以嘗試使用EGGNOG-Mapper來對(duì)你的物種序列進(jìn)行快速注釋瘸右。在注釋結(jié)果文件中，可以同時(shí)獲得序列映射上的GO號(hào)或KO號(hào)岩齿，直接提...
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本氏煙草基因組網(wǎng)站及blast同源基因本氏煙草在瞬時(shí)轉(zhuǎn)化中的運(yùn)用極為廣泛太颤，正好最近在做瞬轉(zhuǎn)，記錄一下盹沈。 本氏煙草基因組網(wǎng)站https://btiscience.org/our-research/research-...
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【RNA-seq自學(xué)09】數(shù)據(jù)分析之差異基因分析DEseq2、可視化1陷揪、在R中安裝DESeq2軟件包 官方網(wǎng)站 2惋鸥、運(yùn)行 準(zhǔn)備工作 DESeq2 進(jìn)行差異分析 可視化展示 畫火山圖 差異基因的提取 根據(jù)第1列是Geneid杂穷，第7,8悍缠，9，10...
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WGCNA學(xué)習(xí)：WGCNA分析實(shí)戰(zhàn)WGCNA筆記第三彈 WGCNA分析原理 WGCNA應(yīng)用場(chǎng)景 WGCNA分析實(shí)踐 本代碼借鑒了生信技能樹的WGCNA教程以及PlanTech的WGCNA課程編寫耐量，轉(zhuǎn)載請(qǐng)注明出...
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復(fù)現(xiàn)SCI論文圖表：棒棒糖圖|漸變|legeng設(shè)置有小伙伴在群里咨詢了一個(gè)圖的做法著榴，如下： （Reference：GRB10 and E2F3 as Diagnostic Markers of Osteoarthritis ...
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WGCNA構(gòu)建共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)三1.導(dǎo)入數(shù)據(jù) 導(dǎo)入第一步生成的網(wǎng)絡(luò)關(guān)系和第二步的性狀之間的關(guān)系。 2. 基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)可視化 2.1. 使用所有基因繪制 官網(wǎng)推薦了用隨機(jī)400條基因作圖屁倔，全部用于作圖的話沒...
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ArcGIS繪制包含主副圖的論文研究區(qū)域概況圖的方法
??最近需要繪制與地學(xué)有關(guān)論文脑又、文獻(xiàn)中的研究區(qū)域概況圖。對(duì)于這一類圖片，我個(gè)人比較喜歡基于ArcMap與PPT結(jié)合的方式來繪制问麸，具體操作如下往衷。 ??當(dāng)然，首先這里要提一句：大...
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轉(zhuǎn)錄組分析
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2022-03-29 運(yùn)行TCRdist本來先運(yùn)行find_cdr3_motifs.py但很多報(bào)錯(cuò)，在pycharm上版本不兼容哮笆，所有print后都沒有括號(hào)来颤，包是用python2寫的，修改了pycharm上接收器版...
