發(fā)簡(jiǎn)信
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「生信」共線性分析——MCScanX目錄MCScanX下載及安裝數(shù)據(jù)準(zhǔn)備MCScanX運(yùn)行及結(jié)果Ka & Ks 計(jì)算下游畫圖腳本最后 MCScanX有兩個(gè)主要的功能, 一是, 方便使用者發(fā)現(xiàn)共線性(collin...
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非模式物種的GO/KEGG注釋對(duì)于非模式物種旁振，需要做GO或KEGG富集获询，可以嘗試使用EGGNOG-Mapper來(lái)對(duì)你的物種序列進(jìn)行快速注釋。在注釋結(jié)果文件中拐袜，可以同時(shí)獲得序列映射上的GO號(hào)或KO號(hào)吉嚣，直接提...
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本氏煙草基因組網(wǎng)站及blast同源基因本氏煙草在瞬時(shí)轉(zhuǎn)化中的運(yùn)用極為廣泛，正好最近在做瞬轉(zhuǎn)蹬铺，記錄一下尝哆。 本氏煙草基因組網(wǎng)站https://btiscience.org/our-research/research-...
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【RNA-seq自學(xué)09】數(shù)據(jù)分析之差異基因分析DEseq2、可視化1歧胁、在R中安裝DESeq2軟件包 官方網(wǎng)站 2滋饲、運(yùn)行 準(zhǔn)備工作 DESeq2 進(jìn)行差異分析 可視化展示 畫火山圖 差異基因的提取 根據(jù)第1列是Geneid，第7,8与帆，9了赌，10...
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WGCNA學(xué)習(xí)：WGCNA分析實(shí)戰(zhàn)WGCNA筆記第三彈 WGCNA分析原理 WGCNA應(yīng)用場(chǎng)景 WGCNA分析實(shí)踐 本代碼借鑒了生信技能樹(shù)的WGCNA教程以及PlanTech的WGCNA課程編寫，轉(zhuǎn)載請(qǐng)注明出...
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復(fù)現(xiàn)SCI論文圖表：棒棒糖圖|漸變|legeng設(shè)置有小伙伴在群里咨詢了一個(gè)圖的做法郭卫，如下： （Reference：GRB10 and E2F3 as Diagnostic Markers of Osteoarthritis ...
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WGCNA構(gòu)建共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)三1.導(dǎo)入數(shù)據(jù) 導(dǎo)入第一步生成的網(wǎng)絡(luò)關(guān)系和第二步的性狀之間的關(guān)系砍聊。 2. 基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)可視化 2.1. 使用所有基因繪制 官網(wǎng)推薦了用隨機(jī)400條基因作圖，全部用于作圖的話沒(méi)...
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ArcGIS繪制包含主副圖的論文研究區(qū)域概況圖的方法
??最近需要繪制與地學(xué)有關(guān)論文贰军、文獻(xiàn)中的研究區(qū)域概況圖玻蝌。對(duì)于這一類圖片，我個(gè)人比較喜歡基于ArcMap與PPT結(jié)合的方式來(lái)繪制词疼，具體操作如下俯树。 ??當(dāng)然，首先這里要提一句：大...
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轉(zhuǎn)錄組分析
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2022-03-29 運(yùn)行TCRdist本來(lái)先運(yùn)行find_cdr3_motifs.py但很多報(bào)錯(cuò)，在pycharm上版本不兼容舵盈，所有print后都沒(méi)有括號(hào)陋率，包是用python2寫的，修改了pycharm上接收器版...
