適用背景 昨天寫的文章[http://www.reibang.com/p/8a81071571d9]介紹了Anndata對(duì)象轉(zhuǎn)成Seurat對(duì)象的流程牛柒,但是比較稀碎,所以這...
學(xué)習(xí)資料來源:scanpy主頁:https://scanpy.readthedocs.io/en/stable/[https://scanpy.readthedocs.io/...
前言 Scanpy是基于Python語言的類似Seurat的單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組分析工具闪彼,本文匯集了Scanpy的常規(guī)操作。 加載模塊和設(shè)置 讀入矩陣 合并多個(gè)對(duì)象 添加注釋 輸出矩...
適用背景 單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組調(diào)控網(wǎng)絡(luò)分析是單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組分析內(nèi)容的高級(jí)分析之一,本文將介紹SCENIC/pySCENIC的流程茉稠,具體原理和內(nèi)容不展開描馅,主要展示代碼復(fù)現(xiàn)流程。R的SCE...
ref[https://blog.csdn.net/baidu_41798699/article/details/120267005] 一定要保存為嵌入字體信息的PDF膀篮,不然...