質(zhì)控原則 好的結(jié)果需要好的數(shù)據(jù)。原始下機(jī)測(cè)序數(shù)據(jù)(raw data)中澜共,有些reads包含有測(cè)序接頭序列向叉,這些序列不屬于測(cè)序物種中的原有序列,因此質(zhì)控過程中需要剪切去除嗦董。同時(shí)...
看到報(bào)錯(cuò)不要怕奇唤,多試試一定會(huì)解決的,嘗試和搜索能力很重要匹摇。 背景: 有天不知道為什么咬扇,我升級(jí)了我的R包,從3.5.1到3.6.1廊勃,結(jié)果報(bào)錯(cuò)就成了常態(tài)懈贺。在做RNA-seq差異分...
@(Dayueban)[腸道菌群|alpha多樣性|beta多樣性] 導(dǎo)讀 很多時(shí)候我們往往拿著現(xiàn)成的數(shù)據(jù)就開始分析了(因?yàn)橛袔熜謳熃愕拇a啊教程氨啤)堡妒,或者干脆是公司測(cè)序和分...
1、去除冗余的reads 結(jié)果: 2尉尾、將bam文件轉(zhuǎn)化為sam文件 結(jié)果: 3烦粒、計(jì)算每個(gè)胞嘧啶的甲基化值 結(jié)果: