1. 整合不同數(shù)據(jù)集中同一類細胞方法： 該方法來自一篇21年5月份的Nature：Cross-tissue organization of the fibroblast li...
IP屬地：江蘇
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多個單細胞數(shù)據(jù)集整合方法 -
10X空間轉(zhuǎn)錄組之空間臨近通訊分析stlearn進階版新的一年纺弊，2022年阿逃，第一周，繼cellphoneDB[http://www.reibang.com/p/845937ce248e]更新到3.0时肿，輔助做空間生態(tài)位細胞通訊之...
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10X空間轉(zhuǎn)錄組高級分析進階版作者庇茫，Evil Genius 單細胞研究已經(jīng)非常多了，空轉(zhuǎn)么螃成，做的人也是相當?shù)纳俚┣强辙D(zhuǎn)也有很多的個性化分析，培訓(xùn)的ppt放出來寸宏，大家隨意查看宁炫。 ppt涉及的空間個性化分...
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復(fù)現(xiàn)NC文章華夫圖(方塊圖)-華麗展示實驗樣本構(gòu)成樣本構(gòu)成是實驗的開端，也是后續(xù)分析的基礎(chǔ)稿壁，所以樣本信息在論文中需要詳細展示袍辞，涉及到你實驗的真實性和可重復(fù)性。一般樣本構(gòu)成可以使用AI做示例圖常摧，有些臨床采樣，可以使用柱狀體的方...
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10X空間轉(zhuǎn)錄組聚類分析回顧之SpaGCN(結(jié)合基因表達信息威创、空間位置和形態(tài)學(xué))隔離的第九天落午，孤獨仍在，但亦師亦友肚豺，今天我們來回顧一下10X空間轉(zhuǎn)錄組聚類的分析軟件SpaGCN溃斋，這個軟件之前分享過，文章在10X空間轉(zhuǎn)錄組聚類分析之圖卷積網(wǎng)絡(luò)（graph ...
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單細胞RNAseq常規(guī)分析流程（10X）降維聚類吸申，類型鑒定梗劫，差異分析 近年來享甸，單細胞測序的成本逐漸降低，使得大眾研究從組織水平轉(zhuǎn)移到單個細胞水平的分析成為可能梳侨。本文主要是簡單介紹一下SingleCellRNAseq...
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我眼中的barcodes.tsv.gz/features.tsv.gz/matrix.mtx.gz前段時間一直在用cellranger count進行單細胞測序數(shù)據(jù)的處理晒旅，不得不說Cell Ranger作為10X Genomics官方的單細胞數(shù)據(jù)處理工具栅盲，功能還是很強大的...
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超全總結(jié)--單細胞+空間轉(zhuǎn)錄組的整合分析方法總結(jié)這一篇我們做一個詳細的總結(jié)谈秫，周五了，疫情還沒結(jié)束拴签，父母也都老了孝常，有時候真的感覺身為兒子實在不孝，常年在外蚓哩，回家很少构灸，家里有點事父母也不會跟我這個兒子說，小病小災(zāi)的也舍不得去醫(yī)...
