雙細(xì)胞是指由于實(shí)驗(yàn)原因火诸，在單細(xì)胞微流控等流程中某個(gè)液滴中含有2個(gè)及以上的細(xì)胞华糖，而在同一個(gè)液滴中的細(xì)胞在后續(xù)分析中帶有相同的Cell Barcode叮称，從而會(huì)被認(rèn)為是一個(gè)細(xì)胞的偽...
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單細(xì)胞數(shù)據(jù)分析筆記3: 雙細(xì)胞去除（DoubletFinder, scDblFinder) -
單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組雙細(xì)胞判別軟件scDblFinder起因：最近有個(gè)問題樣本媒佣，跑完cellranger粤铭，樣本的cellranger結(jié)果如下鞋怀，細(xì)胞數(shù)目極高(3W+)畏铆。在后續(xù)數(shù)據(jù)質(zhì)控分析中雷袋，線粒體基因占比和雙細(xì)胞率均很高，用scDb...
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ggplot2學(xué)習(xí)（四）ggplot2基礎(chǔ)（4）——主題 ggplot2基礎(chǔ)（1）[http://www.reibang.com/p/06a5763de24a]ggplot2基礎(chǔ)（2）——坐標(biāo)軸[...
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不再更新
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周運(yùn)來撮胧，男桨踪，長(zhǎng)大了才會(huì)遇到的帥哥，穩(wěn)健芹啥，瀟灑馒闷，大方，靠譜叁征。一段生信緣纳账，一棵技能樹。生信技能樹核心成員捺疼，單細(xì)胞天地供稿人疏虫，簡(jiǎn)書創(chuàng)作者，單細(xì)胞數(shù)據(jù)科學(xué)家啤呼。
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蛋白ID轉(zhuǎn)基因ID
將Ensembl 中的蛋白ID轉(zhuǎn)化成基因ID,可以通過clusterProfiler這個(gè)包卧秘。如以大鼠的基因與蛋白轉(zhuǎn)化為例;安裝clusterProfiler與大鼠org.Rn...
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RNA velocity分析練習(xí)（四）聚類以及velocity可視化系列回顧：1.RNA velocity分析練習(xí)（一）文件下載以及預(yù)處理2.RNA velocity分析練習(xí)（二）軟件安裝3.RNA velocity分析練習(xí)（三）生成loom...
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MSKCC Research Associate<br>別趕不上野心惕蹄，又辜負(fù)了努力
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你好親 想請(qǐng)教一下有 將時(shí)間順序映射到tsne中 的代碼嗎棒旗？這是我第一次看到
擬時(shí)序分析
簡(jiǎn)要內(nèi)容--擬時(shí)序分析的定義--結(jié)果解讀--------做出結(jié)果（cluster喘批、state）--------確定起始點(diǎn)--------做start····end的圖（并且映...
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這個(gè)世界流行離開旁舰，但我們卻不擅長(zhǎng)告別
