雙細胞是指由于實驗原因墩剖，在單細胞微流控等流程中某個液滴中含有2個及以上的細胞猴凹，而在同一個液滴中的細胞在后續(xù)分析中帶有相同的Cell Barcode，從而會被認為是一個細胞的偽...
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單細胞數(shù)據(jù)分析筆記3: 雙細胞去除（DoubletFinder, scDblFinder) -
單細胞轉(zhuǎn)錄組雙細胞判別軟件scDblFinder起因：最近有個問題樣本岭皂，跑完cellranger郊霎，樣本的cellranger結(jié)果如下，細胞數(shù)目極高(3W+)爷绘。在后續(xù)數(shù)據(jù)質(zhì)控分析中歹篓，線粒體基因占比和雙細胞率均很高，用scDb...
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ggplot2學習（四）ggplot2基礎(chǔ)（4）——主題 ggplot2基礎(chǔ)（1）[http://www.reibang.com/p/06a5763de24a]ggplot2基礎(chǔ)（2）——坐標軸[...
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不再更新
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蛋白ID轉(zhuǎn)基因ID
將Ensembl 中的蛋白ID轉(zhuǎn)化成基因ID,可以通過clusterProfiler這個包搔弄。如以大鼠的基因與蛋白轉(zhuǎn)化為例;安裝clusterProfiler與大鼠org.Rn...
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RNA velocity分析練習（四）聚類以及velocity可視化系列回顧：1.RNA velocity分析練習（一）文件下載以及預(yù)處理2.RNA velocity分析練習（二）軟件安裝3.RNA velocity分析練習（三）生成loom...
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MSKCC Research Associate<br>別趕不上野心吨枉，又辜負了努力
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