雙細(xì)胞是指由于實(shí)驗(yàn)原因丑蛤，在單細(xì)胞微流控等流程中某個(gè)液滴中含有2個(gè)及以上的細(xì)胞嘴脾，而在同一個(gè)液滴中的細(xì)胞在后續(xù)分析中帶有相同的Cell Barcode满败，從而會(huì)被認(rèn)為是一個(gè)細(xì)胞的偽...
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單細(xì)胞數(shù)據(jù)分析筆記3: 雙細(xì)胞去除（DoubletFinder, scDblFinder) -
單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組雙細(xì)胞判別軟件scDblFinder起因：最近有個(gè)問(wèn)題樣本，跑完cellranger懂牧，樣本的cellranger結(jié)果如下，細(xì)胞數(shù)目極高(3W+)。在后續(xù)數(shù)據(jù)質(zhì)控分析中黍氮，線粒體基因占比和雙細(xì)胞率均很高，用scDb...
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ggplot2學(xué)習(xí)（四）ggplot2基礎(chǔ)（4）——主題 ggplot2基礎(chǔ)（1）[http://www.reibang.com/p/06a5763de24a]ggplot2基礎(chǔ)（2）——坐標(biāo)軸[...
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不再更新
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周運(yùn)來(lái)案站，男躬审，長(zhǎng)大了才會(huì)遇到的帥哥，穩(wěn)健蟆盐，瀟灑承边，大方，靠譜石挂。一段生信緣博助，一棵技能樹(shù)。生信技能樹(shù)核心成員痹愚，單細(xì)胞天地供稿人富岳，簡(jiǎn)書(shū)創(chuàng)作者罗心，單細(xì)胞數(shù)據(jù)科學(xué)家。
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蛋白ID轉(zhuǎn)基因ID
將Ensembl 中的蛋白ID轉(zhuǎn)化成基因ID,可以通過(guò)clusterProfiler這個(gè)包城瞎。如以大鼠的基因與蛋白轉(zhuǎn)化為例;安裝clusterProfiler與大鼠org.Rn...
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RNA velocity分析練習(xí)（四）聚類(lèi)以及velocity可視化系列回顧：1.RNA velocity分析練習(xí)（一）文件下載以及預(yù)處理2.RNA velocity分析練習(xí)（二）軟件安裝3.RNA velocity分析練習(xí)（三）生成loom...
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MSKCC Research Associate<br>別趕不上野心，又辜負(fù)了努力
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你好親 想請(qǐng)教一下有 將時(shí)間順序映射到tsne中 的代碼嗎翅溺？這是我第一次看到
擬時(shí)序分析
簡(jiǎn)要內(nèi)容--擬時(shí)序分析的定義--結(jié)果解讀--------做出結(jié)果（cluster脑漫、state）--------確定起始點(diǎn)--------做start····end的圖（并且映...
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這個(gè)世界流行離開(kāi)笑旺，但我們卻不擅長(zhǎng)告別
