論文 Plasma proteome analyses in individuals of European and African ancestry identify ci...
論文 Plasma proteome analyses in individuals of European and African ancestry identify ci...
都2022年了孝赫,竟然還有孟德爾隨機化能發(fā)IF > 10的文章!!乌奇!敲黑板,重點:所用數(shù)據(jù)全都是公共數(shù)據(jù),完全可以復(fù)現(xiàn)!G樽椤!孟德爾隨機化YYDS歡迎留言箩祥,大家一起總結(jié)一下202...
話不多說院崇,直接上代碼 部分結(jié)果展示 step 5. 所有SNP的F-stat值都大于10,因此都納入分析中 step 6. 異質(zhì)性檢測結(jié)果 p = 0.3858222 > 0...
Title: Association between Human Blood Metabolome and the Risk of Alzheimer's Disease L...
哎袍祖,用過這個軟件底瓣,只能說提供的chain file有bug…后來用dbsnp的match找了一遍,用的兩個overlap結(jié)果……
做研究用hg19orhg38基因組盲泛?一行代碼將bw轉(zhuǎn)hg38有沒有想過這個問題:做研究的時候該用hg19還是hg38基因組濒持? 人類基因組版本現(xiàn)狀 1)hg19 -> hg38键耕,例如文獻中使用的是hg19寺滚,你自己的測序數(shù)據(jù)是hg38 2...
前言 我們知道GWAS描述的是snp與表型之間的關(guān)系柑营,即利用線性模型尋找與某種性狀顯著相關(guān)聯(lián)的位點。但是發(fā)揮生物學功能的往往是蛋白質(zhì)村视,蛋白質(zhì)是由轉(zhuǎn)錄本翻譯而來官套,那么建立基因表...
所以每一批提交的job必須全部做完才能提交下一批奶赔?
多行命令并行管理,只需要一個腳本在上游分析中杠氢,多個樣本常常要同時分析站刑,為了節(jié)省時間我們常常會通過寫一個簡單的腳本去運行。 比如對于這樣的一個accessionlist鼻百,樣本數(shù)較少 我們先寫一個比對的腳本 重...
0.NMF NMF是非負矩陣分解围段,也是常用的劃分亞組(亞型)的聚類方法之一咯誊涯。 代碼主要參考了幫助文檔和曾老板的博客:http://www.bio-info-trainee....
混合線性模型 我們說的混合線性模型主要是由固定效應(yīng)和隨機效應(yīng)所構(gòu)成的段磨,固定效應(yīng)是我們主要研究的影響因素取逾,而隨機效應(yīng)是潛在的,影響固定效應(yīng)的因素苹支。對于混合線性模型來說砾隅,隨機效應(yīng)...
你好晴埂,這個軟件下載鏈接能提供一下嗎究反,找不到啊
簡短介紹下如何用GCE確定GWAS閾值GWAS大家都很熟悉了,隨著目前越來越多的重測序文章的發(fā)表儒洛,可見如今SNP數(shù)據(jù)是非常的豐富精耐,以及GWAS也發(fā)展了15年了,如今到了一個后GWAS時代琅锻。GWAS我也做了很多了卦停,...