論文 Plasma proteome analyses in individuals of European and African ancestry identify ci...
發(fā)簡信
IP屬地：湖南
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跟著Nature Genetics學(xué)作圖：R語言ggpairs散點(diǎn)圖一次性展示很多個主成分 -
盤點(diǎn)2022年孟德爾隨機(jī)化高分文章
都2022年了，竟然還有孟德爾隨機(jī)化能發(fā)IF > 10的文章１稀Ａ庑ぁ榜聂！敲黑板，重點(diǎn)：所用數(shù)據(jù)全都是公共數(shù)據(jù)，完全可以復(fù)現(xiàn)Ｋ和！猛拴！孟德爾隨機(jī)化YYDS歡迎留言羹铅，大家一起總結(jié)一下202...
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復(fù)現(xiàn)一篇高分(IF = 11.274)孟德爾隨機(jī)化分析文章-day3話不多說，直接上代碼 部分結(jié)果展示 step 5. 所有SNP的F-stat值都大于10愉昆，因此都納入分析中 step 6. 異質(zhì)性檢測結(jié)果 p = 0.3858222 > 0...
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復(fù)現(xiàn)一篇高分(IF = 11.274)孟德爾隨機(jī)化分析文章-day1
Title: Association between Human Blood Metabolome and the Risk of Alzheimer's Disease L...
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哎职员，用過這個軟件，只能說提供的chain file有bug…后來用dbsnp的match找了一遍跛溉，用的兩個overlap結(jié)果……
做研究用hg19orhg38基因組焊切？一行代碼將bw轉(zhuǎn)hg38
有沒有想過這個問題：做研究的時候該用hg19還是hg38基因組？ 人類基因組版本現(xiàn)狀 1）hg19 -> hg38芳室，例如文獻(xiàn)中使用的是hg19专肪，你自己的測序數(shù)據(jù)是hg38 2...
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GWAS與基因表達(dá)量的聯(lián)合分析前言 我們知道GWAS描述的是snp與表型之間的關(guān)系，即利用線性模型尋找與某種性狀顯著相關(guān)聯(lián)的位點(diǎn)堪侯。但是發(fā)揮生物學(xué)功能的往往是蛋白質(zhì)嚎尤，蛋白質(zhì)是由轉(zhuǎn)錄本翻譯而來，那么建立基因表...
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所以每一批提交的job必須全部做完才能提交下一批乏梁？
多行命令并行管理，只需要一個腳本
在上游分析中关贵，多個樣本常常要同時分析遇骑，為了節(jié)省時間我們常常會通過寫一個簡單的腳本去運(yùn)行。 比如對于這樣的一個accessionlist揖曾，樣本數(shù)較少 我們先寫一個比對的腳本 重...
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很多帖子被下架了翩肌。以后開直播帶貨吧模暗。寫不動技術(shù)貼了。
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Evolution is great!
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實(shí)戰(zhàn)-TCGA數(shù)據(jù)的NMF聚類和可視化0.NMF NMF是非負(fù)矩陣分解站玄，也是常用的劃分亞組（亞型）的聚類方法之一咯枚驻。 代碼主要參考了幫助文檔和曾老板的博客：http://www.bio-info-trainee....
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GWAS基本建模原理混合線性模型 我們說的混合線性模型主要是由固定效應(yīng)和隨機(jī)效應(yīng)所構(gòu)成的晾剖，固定效應(yīng)是我們主要研究的影響因素锉矢，而隨機(jī)效應(yīng)是潛在的，影響固定效應(yīng)的因素齿尽。對于混合線性模型來說沽损，隨機(jī)效應(yīng)...
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你好绵估，這個軟件下載鏈接能提供一下嗎，找不到啊
簡短介紹下如何用GCE確定GWAS閾值
GWAS大家都很熟悉了卡骂，隨著目前越來越多的重測序文章的發(fā)表国裳，可見如今SNP數(shù)據(jù)是非常的豐富，以及GWAS也發(fā)展了15年了全跨，如今到了一個后GWAS時代躏救。GWAS我也做了很多了，...
