論文 Plasma proteome analyses in individuals of European and African ancestry identify ci...
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論文 Plasma proteome analyses in individuals of European and African ancestry identify ci...
都2022年了,竟然還有孟德爾隨機化能發(fā)IF > 10的文章!K悦啊!敲黑板狮含,重點:所用數(shù)據(jù)全都是公共數(shù)據(jù)胯努,完全可以復現(xiàn)6巍@惆参咙!孟德爾隨機化YYDS歡迎留言龄广,大家一起總結一下202...
話不多說硫眯,直接上代碼 部分結果展示 step 5. 所有SNP的F-stat值都大于10,因此都納入分析中 step 6. 異質性檢測結果 p = 0.3858222 > 0...
Title: Association between Human Blood Metabolome and the Risk of Alzheimer's Disease L...
哎择同,用過這個軟件两入,只能說提供的chain file有bug…后來用dbsnp的match找了一遍,用的兩個overlap結果……
做研究用hg19orhg38基因組敲才?一行代碼將bw轉hg38有沒有想過這個問題:做研究的時候該用hg19還是hg38基因組裹纳? 人類基因組版本現(xiàn)狀 1)hg19 -> hg38择葡,例如文獻中使用的是hg19,你自己的測序數(shù)據(jù)是hg38 2...
前言 我們知道GWAS描述的是snp與表型之間的關系剃氧,即利用線性模型尋找與某種性狀顯著相關聯(lián)的位點敏储。但是發(fā)揮生物學功能的往往是蛋白質,蛋白質是由轉錄本翻譯而來朋鞍,那么建立基因表...
所以每一批提交的job必須全部做完才能提交下一批滥酥?
多行命令并行管理更舞,只需要一個腳本在上游分析中,多個樣本常常要同時分析坎吻,為了節(jié)省時間我們常常會通過寫一個簡單的腳本去運行缆蝉。 比如對于這樣的一個accessionlist,樣本數(shù)較少 我們先寫一個比對的腳本 重...
0.NMF NMF是非負矩陣分解,也是常用的劃分亞組(亞型)的聚類方法之一咯仿村。 代碼主要參考了幫助文檔和曾老板的博客:http://www.bio-info-trainee....
混合線性模型 我們說的混合線性模型主要是由固定效應和隨機效應所構成的,固定效應是我們主要研究的影響因素畏鼓,而隨機效應是潛在的酱酬,影響固定效應的因素。對于混合線性模型來說云矫,隨機效應...
你好,這個軟件下載鏈接能提供一下嗎挑社,找不到啊
簡短介紹下如何用GCE確定GWAS閾值GWAS大家都很熟悉了陨界,隨著目前越來越多的重測序文章的發(fā)表,可見如今SNP數(shù)據(jù)是非常的豐富痛阻,以及GWAS也發(fā)展了15年了菌瘪,如今到了一個后GWAS時代。GWAS我也做了很多了阱当,...