240 發(fā)簡信
IP屬地：廣東
  • GEO單細胞測序數(shù)據(jù)樣本拆分

    這個數(shù)據(jù)包括了10個單細胞樣本，但是他們事先將數(shù)據(jù)合并了幢哨，其實我只需要其中的3個樣本道逗，所以我需要拆分一下1.加載數(shù)據(jù) 2.正式拆分姚炕，使用tidyverse函數(shù) 3.按照樣本將...

  • 120
    生信小白開始接活——文本處理（二）

    上篇處理了最簡單的單細胞公共數(shù)據(jù)囊嘉，即1個樣本對應(yīng)1個矩陣文件（tsv）谨履，讀取統(tǒng)計就行了这橙，但是GEO公共數(shù)據(jù)庫中還存在如下的情況：例如GSE178318奏窑，15個樣本的信息全部混...

  • 120
    肝癌單細胞測序數(shù)據(jù)集查詢

    1. GSE138709 5個腫瘤樣本 + 3個鄰近的正常組織 數(shù)據(jù)集鏈接：GEO Accession viewer (nih.gov)[https://www.ncbi.n...

  • 120
    R語言ggstatsplot包做卡方檢驗

    -如圖所示埃唯，卡方值為15.01，p = 0.005 < 檢驗水準0.05鹰晨，可認為鉆石的顏色與分類不獨立墨叛，即存在關(guān)聯(lián)。-各個clarity的組內(nèi)比較模蜡，不同顏色鉆石的數(shù)量的差異均...

  • 120
    統(tǒng)計方法的選擇（3）--非參數(shù)檢驗

    前面探索了如果對數(shù)據(jù)進行了數(shù)據(jù)分布檢驗漠趁，發(fā)現(xiàn)符合正態(tài)分布，并且數(shù)據(jù)方法齊性忍疾，那么就可以采用參數(shù)檢驗的方法進行統(tǒng)計檢驗闯传。如果數(shù)據(jù)的分布不符合正態(tài)分布或者方差齊性，那么就要采用非...

  • 批量處理——apply批量計算組間差異

    相比于網(wǎng)頁工具卤妒，使用編程語言處理科研數(shù)據(jù)的一大優(yōu)勢甥绿，在于高度的定制化，以及批量處理數(shù)據(jù)的快捷性和高效性 對于批量處理數(shù)據(jù)的方法则披，之前使用for循環(huán)和apply語句進行處理過妹窖，...

  • 使用R下載HPA數(shù)據(jù)庫的免疫組化數(shù)據(jù)

    HPA數(shù)據(jù)庫有豐富的切片數(shù)據(jù)和免疫組化的切片，可以從網(wǎng)站一個個下載保存收叶，然后把對應(yīng)的信息保存，再重命名共苛，再次比對信息判没。 但是，這樣的操作隅茎，可謂耗時耗力澄峰，還有可能在對比的時候出...

  • 120
    批量處理——for循環(huán)批量計算組間差異

    相比于網(wǎng)頁工具，使用編程語言處理科研數(shù)據(jù)的一大優(yōu)勢，在于高度的定制化魂毁，以及批量處理數(shù)據(jù)的快捷性和高效性 對于批量處理數(shù)據(jù)的方法玻佩，之前使用for循環(huán)和apply語句進行處理過，...

  • 120
    ggplot2優(yōu)化小提琴圖（添加組間差異顯著性烦秩，基礎(chǔ)知識）

    這里不直接用ggplot2畫垮斯，因為要做差異分析，所以直接用ggpubr step0.數(shù)據(jù)讀取 load("Type.Rdata") 首先外面是一個小提琴圖只祠，中間一個箱式圖兜蠕，然...

亚洲A日韩AV无卡,小受高潮白浆痉挛av免费观看,成人AV无码久久久久不卡网站,国产AV日韩精品