您好棍潘，請(qǐng)問(wèn)一下這個(gè)結(jié)果可以復(fù)刻出來(lái)嘛 最近正在復(fù)刻里面腎臟的數(shù)據(jù) （10x下的） 最后得到的TE特異性位點(diǎn)的tsv 文件感覺(jué)怪怪的 不知道能不能幫忙看一下??
SpatialTE：從空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)集分析轉(zhuǎn)座因子表達(dá)的工具 | 空間轉(zhuǎn)錄組分析工具推薦空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)（ST）正在改變我們研究基因表達(dá)的方式鹅搪。然而在大量轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)中眷柔，轉(zhuǎn)座因子（TE）由于其高度重復(fù)性而未被研究窃植。近年來(lái)趴腋，TEs被認(rèn)為是基因表達(dá)的重要調(diào)節(jié)因子勘纯。因此挖函，以...
目前關(guān)于空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)的許多文獻(xiàn)是技術(shù)性的，并不面向不熟悉該領(lǐng)域的研究人員必怜。近日肉拓，《Genome Medicine》發(fā)表了一篇綜述文章為空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)提供了一個(gè)入門(mén)指南：涵蓋了生...
識(shí)別空間域（即在基因表達(dá)和組織學(xué)上具有空間相關(guān)性的區(qū)域）是空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)中最重要的課題之一。近日梳庆，《Nucleic Acids Research》發(fā)表了一個(gè)準(zhǔn)確且通用的深度學(xué)習(xí)...
空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)（ST）正在改變我們研究基因表達(dá)的方式。然而在大量轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)中驻售，轉(zhuǎn)座因子（TE）由于其高度重復(fù)性而未被研究露久。近年來(lái)，TEs被認(rèn)為是基因表達(dá)的重要調(diào)節(jié)因子欺栗。因此毫痕，以...
還在羨慕海峽那邊的朋友下載SRA 快到飛起？還在難過(guò)用wget 下載數(shù)據(jù)經(jīng)常下載不完整纸巷？用了官方的下載工具還是慢的不行镇草？這里有一個(gè)SRA 下載自救嘗試指南供你參考。 需要用到...
重復(fù)序列廣泛存在于真核生物基因組中, 這些重復(fù)序列或集中成簇, 或分散在基因之間瘤旨。根據(jù)分布把重復(fù)序列分為散在重復(fù)序列和串聯(lián)重復(fù)序列梯啤。 重復(fù)序列的分類(lèi) 重復(fù)序列注釋流程 參考腳...
作者，Evil Genius 這一篇我們繼續(xù)分享關(guān)于空間通訊的內(nèi)容嵌施，今天偷個(gè)懶饲化。 10X Visium HD平臺(tái)已經(jīng)發(fā)布，高精度平臺(tái)吗伤，配套loupe軟件吃靠，看起來(lái)幾乎是無(wú)敵的，...
學(xué)習(xí)目標(biāo) 學(xué)習(xí)用DiffBind流程評(píng)估兩個(gè)樣本間的差異結(jié)合區(qū)域 用PCA評(píng)估樣本間的關(guān)系 評(píng)估不同工具得到的差異peaks的一致性 評(píng)估差異peaks富集的工具 ATAC-...
首先附上軟件鏈接：https://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/html/systemPipeR.htmlhttp:/...
?我們關(guān)注蛋白質(zhì)的功能弥姻，而結(jié)構(gòu)和功能聯(lián)系緊密南片。一旦在氨基酸序列水平發(fā)現(xiàn)有趣的序列（比如一個(gè)模體（motif）或者進(jìn)化上保守的片段），下一步往往就是研究這段序列的3-D結(jié)構(gòu)庭敦。（...
