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    第7章:T細(xì)胞受體(TCR)概述2021-04-17

    導(dǎo) 讀 本章介紹T細(xì)胞的抗原識別分子,即T細(xì)胞受體(TCR)腰湾。上圖概述了TCR組裝的主要步驟棉浸。如第2章所述凝危,TCRs識別肽抗原有一個必要條件昆烁,那就是該抗原需要由自身主要組織相...

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    單細(xì)胞Seurat V5分析流程

    自從seurat V5更新之后呢,很多小伙伴区岗,初學(xué)者居多吧略板,都有點(diǎn)不適應(yīng),再加上網(wǎng)上有些人的“煽風(fēng)點(diǎn)火”慈缔,導(dǎo)致大家望而卻步叮称,好像這次更新非常可怕一樣藐鹤。其實(shí)不然颅拦,seurat的...

  • Seurat的三種單細(xì)胞數(shù)據(jù)整合方法匯總(批次校正)2022-05-24

    關(guān)鍵詞 批次效應(yīng) 批次校正 單細(xì)胞數(shù)據(jù)整合 適用背景 單細(xì)胞數(shù)據(jù)由于實(shí)驗(yàn)平臺或樣本等原因會造成不同數(shù)據(jù)集之間存在批次效應(yīng),這種批次效應(yīng)是人為因素造成的悄窃,沒有實(shí)際的生物學(xué)意義讥电,...

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    2021-05-23 ChIP-seq數(shù)據(jù)從頭到尾比對及分析匯總(個人分析記錄貼)

    0_1 前言 有時間再詳細(xì)寫introduction。先把我分析數(shù)據(jù)的流程記錄下來轧抗,后續(xù)持續(xù)更新恩敌。 0_2 用到的軟件或腳本 測序數(shù)據(jù)質(zhì)控:fastp[https://git...

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    如何提取ATAC-seq數(shù)據(jù)的差異peaks?(DiffBind包的使用)

    2021年開年第一篇筆記~ 這篇筆記主要記錄DiffBind包的學(xué)習(xí)。在很久以前我寫過一篇ATAC-seq分析流程(ATAC-seq分析練習(xí)[https://www.jian...

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    ChIP-seq實(shí)踐(H3K27Ac,enhancer的篩選和enhancer相關(guān)基因的GO分析)

    在實(shí)踐之前横媚,我先查找了一下有關(guān)組蛋白修飾的知識點(diǎn):(參考文章:http://www.reibang.com/p/8aca72809c5c) 組蛋白修飾能預(yù)測染色質(zhì)的類型(異...

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