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分離體分組混合分析法（Bulked Sergeant Analysis, BSA）也稱為集群分離分析法或混合分組分析法，是從近等基因系分析法演變而來的。常規(guī)的育種通常從近等基...

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1. 軟件安裝 軟件是python寫的拖叙，不需要安裝但是需要安裝需要的庫到推。 Numpy, Scipy, Matplotlib. 2. 輸入文件要求 =====matrix格式的...

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SubPhaser原文鏈接：https://nph.onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/nph.18173[https://nph.onl...

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寫在前面 那天夏老師突然給我了一個電話匣距，大體是提了這么一個想法疏旨，亦即失受，「BLAST Zone」挺好的讶泰，但如果可以加上「One Step ML Tree」似乎就更好了咏瑟。當然，這...

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寫在前面 今天周末码泞，人在貴陽。BLAST Zone 這個功能狼犯，我太喜歡了余寥。寫出來之后，基本我天天用悯森。主要原因還是簡單宋舷，他確實比以前各個 BLAST GUI Wrapper 功...

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RIP和RNA pulldown都是研究RNA和蛋白相互作用的經典方法绎狭，只是出發(fā)點不一樣而已。 RIP褥傍，RNA 結合蛋白便宜共沉淀坟岔，是從蛋白出發(fā)研究蛋白RNA相互作用的技術。...

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測序技術的飛速發(fā)展積累了大量轉錄組數據摔桦，從中也發(fā)現了很多新的轉錄本。區(qū)分這些轉錄本是蛋白編碼序列還是非編碼序列是基因組注釋和新基因鑒定中的重要研究內容承疲。但對于大量存在的無訓練...

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在lncRNA機制研究里邻耕，有一小眾人群在做SNP調控lncRNA表達，或功能改變的機制研究燕鸽，不少CNS文章兄世。SNP是突變位點，已報道許多重要的SNP與疾病密切關聯啊研。那么這些S...

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前言 MEGENA是一種基于圖嵌入的方式構建基因共表達網絡的工具御滩，相比較于WGCNA的權重分析，MEGENA直接用圖對嵌入來完成党远，因此更加接近于真實情況 MEGENA理論 O...

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導讀 利用富集分析削解，我們可以把很多看著雜亂的差異基因總結出一個比較整體反應事件發(fā)生的概述性的句子。 例如：TP53信號通路和胃癌的發(fā)生有關沟娱。而不是說BAX氛驮、BID、ABL1济似、...

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Ka盏缤，Ks（或Dn，Ds）蓖扑，這兩個值以及他們的比值分別被賦予了一定的生物學意義唉铜。其中最為常用的是兩者的比值，存在這么一種常見認知： ka/ks>>1 正選擇 ka/ks~1 ...

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寫在寫在前面的前面 或許潭流，沒有人知道TBtools到底是什么？能干啥俩功。但是看完這個推文幻枉，或許你就知道了其中的一部分。 寫在前面 TBtools對外開放兩年多诡蜓，不時會有熟悉的不...

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森言森語 TBtools是一款優(yōu)秀的生物信息學軟件，也是我最早接觸的生物信息學軟件蔓罚。從接觸到現在差不多一年椿肩，邊使用，邊積累豺谈，算是學習路上的一款啟蒙軟件郑象。有幸在我寫公眾號記錄分...

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此視頻來自B站，是非常好和全的的一個GWAS操作的視頻茬末，從開始準備軟件下載厂榛，數據過濾，到最后的候選基因注釋丽惭。GWAS的實戰(zhàn)視頻https://www.bilibili.com...

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本文是對WGCNA英文說明文檔的翻譯击奶，英文的請查看這里[https://horvath.genetics.ucla.edu/html/CoexpressionNetwork/...