Cutadapt安裝 基本命令 例子: 常用參數(shù) 參數(shù)詳解 Removing adapters Adapter 移除 Anchored 5’ adapters:adapter...
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寫在前面 以下內(nèi)容均來自我在菲沙基因(Frasergen[http://www.frasergen.com/])暑期生信培訓(xùn)班上記錄的課堂筆記 1.Hi-C 輔助組裝(PGA...
寫在前面 初始組裝經(jīng)過基因組糾錯(cuò)(polish)以及去冗余(purge)之后禁筏,就可以將其掛載到染色體上持钉,使其由contig/scaffold級(jí)別的基因組提升到chromoso...
數(shù)據(jù)準(zhǔn)備:?jiǎn)伪缎突蚪M(hap1.p_ctg.fa和hap2.p_ctg.fa)和HIC數(shù)據(jù) 軟件安裝:3D-DNA冻晤、Juicer、BWA绸吸、Juicebox(win或mac安...
共線性 共線性片段是指一個(gè)同一個(gè)物種內(nèi)部或者兩個(gè)物種之間鼻弧,由基因組復(fù)制、染色體復(fù)制惯裕、大片段復(fù)制以及物種分化而產(chǎn)生的大片段同源現(xiàn)象温数。同源片段內(nèi)部基因排序保守,意味著功能上也可能...
目錄MCScanX下載及安裝數(shù)據(jù)準(zhǔn)備MCScanX運(yùn)行及結(jié)果Ka & Ks 計(jì)算下游畫圖腳本最后 MCScanX有兩個(gè)主要的功能, 一是, 方便使用者發(fā)現(xiàn)共線性(collin...
生信學(xué)習(xí)資料 自學(xué)生信不求人,現(xiàn)在網(wǎng)上資料越來越豐富歉井,但是資料多也意味著魚龍混雜肌括,并且讓人無從選擇。正確做法應(yīng)該是,找一個(gè)適合自己且完善靠譜的學(xué)習(xí)資料谍夭,從頭到尾跟一遍,代碼敲...