博主有沒有公眾號啊
通俗易懂WGCNA(2)正文 正文部分梧却，我想盡可能的從原理出發(fā)置谦，講解WGCNA背后的大致邏輯蚤认。我盡可能的在這部分不介紹代碼辛萍，以免喧賓奪主般的干擾我們對于WGCNA原理的思考儒搭。 先簡單給個目錄悲柱，WGC...
發(fā)簡信
IP屬地：河北
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如何給Seurat對象的基因重命名捧请？【基因名轉(zhuǎn)換】2022-07-27
適用背景 在單細胞分析中凡涩，必要的一步是對每個細胞進行注釋，這相當于給每個細胞打個標簽疹蛉，或者說起個別名活箕，這些信息都存在@meta.data信息里，所以不用特意去更改細胞名字可款，S...
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玩轉(zhuǎn)單細胞(7)：修改Seurat對象基因名稱玩轉(zhuǎn)單細胞(2):Seurat批量做圖修飾[http://mp.weixin.qq.com/s?__biz=Mzg5OTYzMzY5Ng==&mid=2247486164&i...
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博主 有沒有后續(xù)呀 兩年沒更新了
如何優(yōu)雅的閱讀Seurat包
20211109（周二）1.今天準備學習scanpy單細胞分析包闺鲸，走在路上想筋讨，我用seurat和scanpy的意義在哪里，多學一個軟件嗎摸恍？學習軟件后面的代碼邏輯 遠遠大于學會...
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如何優(yōu)雅的閱讀Seurat包20211109（周二）1.今天準備學習scanpy單細胞分析包悉罕，走在路上想，我用seurat和scanpy的意義在哪里立镶，多學一個軟件嗎壁袄？學習軟件后面的代碼邏輯 遠遠大于學會...
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Seurat單細胞分析常見代碼-01
1.如何通過Seurat對象獲取細胞對應的坐標? 2.如何通過Seurat對象獲取原始表達數(shù)據(jù)? 3.提取特定基因陽性表達的細胞？ 4.修改tsne/umap圖的配色 5.查...
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作者有沒有公眾號呀
2022-11-20周末隨記
2022年11月20日 周天今天沒有想工作的任何事情谜慌，也沒開電腦然想，放空大腦，曬太陽欣范，看閑書变泄。初冬暖陽令哟，如沐慈悲。我在想卷的這個事情妨蛹，大家都在知識或者價值的隊伍中排隊屏富，或者說，...
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博主的微信公眾號是啥呀
單細胞ChIP-seq方法的比較
寫在前面的廢話 這篇文章來自于一個舔狗的悲哀蛙卤，謹以此文告訴大家莫當舔狗…… 以上聊天記錄狠半，就是整個故事背景。當時我的內(nèi)心歷程： 我看過類似的文章欸颤难，趕緊發(fā)出來展現(xiàn)一下我的閱讀...
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GeneOverlap: 用于基因Overlap的檢驗及可視化R包參考學習資料：https://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/vignettes/GeneOverlap/inst/do...
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NCBI下載SRA數(shù)據(jù)的4種方法??作為生命科學的從事者神年，不論是老師或者學生都應該用過NCBI((National Center for Biotechnology Information Search d...
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博主公眾號名稱是什么呀
生信 | 基因組組裝實戰(zhàn)（四）：組裝軟件mecat2、flye行嗤、wtdbg2已日、Canu、Falcon
寫在前面 以下內(nèi)容均來自我在菲沙基因（Frasergen[http://www.frasergen.com/]）暑期生信培訓班上記錄的課堂筆記 1.基因組概念 基因組應該指單...
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生信 | 基因組組裝實戰(zhàn)（一）：基礎知識與基本思路寫在前面 以下內(nèi)容均來自菲沙基因（Frasergen[http://www.frasergen.com/]）暑期生信培訓班課堂筆記 1. Genome de nove 基礎知...
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2022-11-20周末隨記
2022年11月20日 周天今天沒有想工作的任何事情栅屏，也沒開電腦飘千，放空大腦，曬太陽栈雳，看閑書护奈。初冬暖陽，如沐慈悲哥纫。我在想卷的這個事情霉旗，大家都在知識或者價值的隊伍中排隊，或者說磺箕，...
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R語言中dplyr包join函數(shù)之目前我看到過的最形象的教程所涉及的函數(shù) Mutating Joins: inner_join(), left_join(), right_join(), full_join() Filtering J...
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Linux中常規(guī)命令無法使用的解決方法
這是因為在改環(huán)境變量的時候沒有配置正確的原因简僧，需要在命令行寫： export PATH=/usr/local/sbin:/usr/local/bin:/sbin:/bin:/...
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討厭又迷人的reads去重復在NGS分析入門階段岛马，我們不需要考慮太多的細節(jié)，只用知道一個分析的大致流程并完整跑下來即可屠列。太多的細節(jié)啦逆，只會讓我們對于分析產(chǎn)生莫須有的恐懼，因此一些“無關(guān)緊要“細節(jié)就被我們刻...
