共病遺傳（或稱異病同根）榛了，我們對疾病的認(rèn)識(shí)從回溯至遺傳學(xué)根源的那一刻起就已經(jīng)進(jìn)入了另一個(gè)新的里程丐怯。 今天我想分享一篇今年9月24日發(fā)表于 《Nature communicat...
IP屬地：安徽
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共病遺傳的研究方法：關(guān)于多發(fā)性硬化癥和炎癥性腸炎遺傳共病研究的例子 -
表達(dá)數(shù)量性狀位點(diǎn)（eQTL）的概念及其相關(guān)分析
表達(dá)數(shù)量性狀位點(diǎn)（expression quantitative trait locus, eQTL）是一類能夠影響基因表達(dá)量的遺傳位點(diǎn)（大部分都是單核苷酸多態(tài)性，SNP）泌类，...
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2020-05-04 eigenMT
eigenMT：解釋變異間連鎖不平衡的eQTL研究的有效多重檢驗(yàn)調(diào)整 簡介 特征最小二乘法是順式eQTL研究中一種計(jì)算效率較高的多重檢驗(yàn)校正方法。通常底燎，現(xiàn)代順式eQTL研究可...
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使用OSCA進(jìn)行eQTL分析Nathan寫于20200807刃榨。OSCA（OmicS-data-based Complex trait Analysis）是楊老師2019年發(fā)表的用于分析多組學(xué)數(shù)據(jù)復(fù)雜性狀...
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單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序中的降維和聚類前言 在以往常規(guī)轉(zhuǎn)錄組測序中枢希，由于實(shí)驗(yàn)生物學(xué)重復(fù)，同組內(nèi)測序得到的數(shù)據(jù)是接近的朱沃，通過簡單的線性降維PCA主成分分析法苞轿，即可得到想要的可視化結(jié)果（組內(nèi)樣本聚集，組間樣本分離）逗物。...
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中山大學(xué)中山醫(yī)學(xué)院-基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)博士在讀<br>歡迎關(guān)注個(gè)人公眾號(hào)<br><br>公眾號(hào)：bioinfomics<br>博客：<a href="https://links.jianshu.com/go?to=https%3A%2F%2Fdongwei1220.github.io%2F" target="_blank">https://dongwei1220.github.io/</a><br>
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文獻(xiàn)2——scGraph：一種基于圖神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的自動(dòng)識(shí)別細(xì)胞類型的方法scGraph: a graph neural network-based approach toautomatically identify cell types http...
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清明節(jié)后第一天從畫一張圖開始今天我們的任務(wù)就是復(fù)現(xiàn)一張圖翎卓，如下： 來吧契邀，這個(gè)圖的復(fù)現(xiàn)不見得簡單，不信大家可以嘗試一下： 首先來學(xué)習(xí)一下ggrepel包 用法是geom_text(label)_repel...
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單細(xì)胞之軌跡分析-2：monocle2 原理解讀+實(shí)操軌跡分析系列： 單細(xì)胞之軌跡分析-1：RNA velocity[http://www.reibang.com/p/ee0f7a8e6a06] 擬時(shí)間序列分析（Pseudot...
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單細(xì)胞文獻(xiàn)6-COVID-19患者的免疫反應(yīng)的單細(xì)胞景觀Single-cell landscape of immunological responses in patients with COVID-19 影響因子： 20.479...
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單細(xì)胞文獻(xiàn)12- 持續(xù)感染 SARS-CoV-2 的 COVID-19 患者的臨床和分子特征Clinical and molecular characteristics of COVID-19 patients with persistent SARS-CoV-2 ...
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搬磚的工人<br>
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R數(shù)據(jù)可視化20:弦圖終于超過1k粉絲啦～之前說要小小慶祝一下允瞧，害怕直接放文章里會(huì)被封文章，所以福利大家可以見評論。前幾周忙著答辯畢業(yè)事宜沒有時(shí)間更新述暂，雖然這幾天也挺忙哈哈哈哈痹升，不過還是要定期更新...
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R-ggplot2-箱圖系列（2） 注釋P值與組間比較R-ggplot2-箱圖系列（1） basic - 簡書 (jianshu.com)[http://www.reibang.com/p/bafbd08b28ef]R-ggp...
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R數(shù)據(jù)可視化21:Edge Bundling圖N久沒有更新了，最近一段時(shí)間有點(diǎn)繁忙畦韭。今天疼蛾，一起來學(xué)習(xí)一下一個(gè)和Circo圖差不多的圖：Edge Bunding圖（不知道中文咋翻譯）。其實(shí)在我看來都只是不同形式的網(wǎng)絡(luò)圖艺配。 ...
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統(tǒng)計(jì)學(xué)習(xí)方法5.2 - 5.5 筆記5.2 決策樹 -- 條件概率分布 如果有10個(gè)條件概率分布察郁，對應(yīng)特征空間的10個(gè)劃分，相當(dāng)于構(gòu)建了10棵決策樹转唉。特征空間由特征向量組成皮钠，特征向量表示輸入的每一個(gè)實(shí)例。一般認(rèn)...
