酷睿_1991

主要講述PyMOL中常見的圖形界面（鼠標(biāo)）操作 1.認(rèn)識PyMol 1. 軟件界面介紹 1.2 內(nèi)置demo介紹 打開PyMOL,點(diǎn)擊1.1菜單窗口的Wizard菜單杠袱，然后點(diǎn)...

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今天要模仿的圖片來自于論文 Core gut microbial communities are maintained by beneficial interactions ...

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論文 Microbiome differential abundance methods produce different results across 38 datase...

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clusterProfiler是業(yè)界大神Y叔寫的R包，看過了它的繪圖就會使人沉迷于其顏值無法自拔。本文很多內(nèi)容直接翻譯自官方文檔，加上了我的測試數(shù)據(jù)（還是以果蠅為例）。 一嗓蘑、...

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說在前面 在國內(nèi)做生信的小伙伴或多或少都聽過一個(gè)大名鼎鼎的名字---Y叔泄隔，想當(dāng)初小編初入生信大門時(shí)還專門百度查了一下，他就是南方醫(yī)科大學(xué)生物信息學(xué)系主任余光創(chuàng)教授宛徊。Y叔在國際...

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對于基因的差異表達(dá)譜佛嬉，常用熱圖作為展示。但有時(shí)差異基因可能非常的多闸天，熱圖中不可能將所有基因的名稱標(biāo)注出來暖呕。那么此時(shí)不妨選擇一些比較重要的基因（比方說p值最顯著的那些），在圖中...

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當(dāng)我們畫熱圖（heatmap）的時(shí)候湾揽，如果基因的名字比較多的時(shí)候，在熱圖中展示的話，就會出現(xiàn)名字重疊的情況库物，針對這個(gè)情況霸旗，我們有兩種比較好的解決辦法，第一是在熱圖中僅顯示關(guān)注...

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突然間發(fā)現(xiàn)戚揭，我一做熱圖就用pheatmap幾乎不存在第二個(gè)選項(xiàng)了定硝。是時(shí)候跑一遍pheatmap的demo了. Examples scale是一個(gè)值得注意的參數(shù)，它旨在說明你想...

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分化時(shí)間是宏觀進(jìn)化的內(nèi)容毫目，以某一特定類群的化石記錄作為參照點(diǎn)，通過基因序列間的分歧程度以及分子鐘來估計(jì)速率恒定分支間的分歧時(shí)間诲侮，同時(shí)計(jì)算系統(tǒng)發(fā)育樹上其他節(jié)點(diǎn)的發(fā)生時(shí)間镀虐，從而推...

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論文 https://www.pnas.org/content/118/20/e2010588118[https://www.pnas.org/content/118/20/...

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1 簡介 BCFtools 是一款多種實(shí)用工具的集合哟沫，它可以用于處理VCF文件和二進(jìn)制的BCF文件饺蔑。它可以接受VCF格式、壓縮的VCF格式以及BCF格式嗜诀，并能自動檢測輸入的格...

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hello猾警，大家好，今天我們來實(shí)現(xiàn)一下下面的這張熱圖 我們最關(guān)注的就是圖的右邊只標(biāo)記感興趣的基因裹虫，如何實(shí)現(xiàn)呢肿嘲？？筑公？ 準(zhǔn)備作圖文件 接下來雳窟，讓我們來實(shí)現(xiàn)一下上面的熱圖。 為了繪...

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筆記內(nèi)容：由二代測序產(chǎn)生的序列數(shù)據(jù)（fastq格式）到物種豐度的OTU table， 樣本群落距離矩陣惩坑，物種多樣性指數(shù)掉盅，序列的進(jìn)化樹及物種注釋信息的分析結(jié)果，為常規(guī)分析流程以舒。...

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分享一個(gè)ggplot2繪制人體結(jié)構(gòu)圖的小例子趾痘，喜歡的小伙伴可以關(guān)注個(gè)人公眾號R語言數(shù)據(jù)分析指南[https://mp.weixin.qq.com/s/pGpUYiVzxlK1...