一 基礎(chǔ)知識(shí) 1、什么是富集分析边翼？ 富集分析的原理一個(gè)生物過(guò)程通常是由一組基因共同參與征懈，而不是由單個(gè)基因獨(dú)自完成。富集分析的基本前提假設(shè)是俏扩，如果一個(gè)生物學(xué)過(guò)程在已知的研究中發(fā)...
發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：湖南
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基因功能富集 -
偶爾更新动猬，需要沉淀
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一個(gè)R包搞定22種單細(xì)胞基因差異分析參考文獻(xiàn)：Confronting false discoveries in single-cell differential expression[https://doi.o...
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R語(yǔ)言向量元素的增刪改查基本操作
增 R語(yǔ)言的索引是從1開(kāi)始的 當(dāng)我們?cè)L問(wèn)不存在的索引的時(shí)候赁咙，他不會(huì)報(bào)錯(cuò)钮莲，而是以NA代替，類似于python里面的None,大家注意比較一下彼水！在這里崔拥，我直接為索引為5的元素賦值...
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一條小咸魚(yú)
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最大似然法 （1）基本原理以下內(nèi)容都是基于Christopher P. Randle教授在研究組上交流時(shí)的課件整理而來(lái)链瓦。 最大似然法選擇的最優(yōu)樹(shù)是使得觀察到的性狀分布（character state ...
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泛基因組 | 簡(jiǎn)介一慈俯、什么是泛基因組？ 2005年拥峦，Tettelin等人提出了微生物泛基因組概念（pangenome贴膘，pan源自希臘語(yǔ)‘παν’，全部的意思）略号，泛基因組即刑峡。2009 年，Li等...
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RPKM、FPKM羽利、TPM詳解
簡(jiǎn)寫 RPKM: Reads Per Kilobase of exon model per Million mapped reads (每千個(gè)堿基的轉(zhuǎn)錄每百萬(wàn)映射讀取的rea...
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剛?cè)腴T生物信息的研究僧铐伴，目前就讀于海南大學(xué)撮奏，在中國(guó)熱帶農(nóng)業(yè)科學(xué)院橡膠所進(jìn)行實(shí)驗(yàn)俏讹，本簡(jiǎn)書賬號(hào)發(fā)布一些生信學(xué)生過(guò)程中的筆記與廣大生信人一起交流學(xué)習(xí)。有問(wèn)題或者是交流請(qǐng)聯(lián)系郵箱:linxianzu1995@163.com
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RPKM畜吊，F(xiàn)PKM和TPM明確解釋
RPKM泽疆，F(xiàn)PKM和TPM明確解釋| RNA-Seq博客 來(lái)自StatQuest 過(guò)去，當(dāng)您進(jìn)行RNA測(cè)序時(shí)玲献，您以RPKM（Reads Per Kilobase Millio...
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GWAS分析 (一)接觸全基因組關(guān)聯(lián)分析（GWAS）已經(jīng)一年半有余捌年，從剛開(kāi)始對(duì)GWAS的全然無(wú)知到現(xiàn)在慢慢了解瓢娜，越來(lái)越能體會(huì)到這項(xiàng)技術(shù)的了不起。同時(shí)礼预，越來(lái)越多的科研工作者也在使用這項(xiàng)技術(shù)眠砾，然后就...
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高通量測(cè)序領(lǐng)域常用名詞解釋【轉(zhuǎn)】
作為一個(gè)已經(jīng)在生物信息行業(yè)摸爬兩年的小白，還是有必要重新認(rèn)識(shí)一下高通量測(cè)序領(lǐng)域的一些常用名詞托酸。什么是高通量測(cè)序褒颈？高通量測(cè)序技術(shù)（High-throughput sequenc...
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全基因組關(guān)聯(lián)分析 (GWAS) - 簡(jiǎn)介在碩士就讀期間，就已經(jīng)做過(guò) GWAS 相關(guān)的分析励堡。當(dāng)時(shí)標(biāo)記量非常少谷丸， windows 系統(tǒng)分析就足夠了，作圖方面涉及的腳本也基本是蔡師兄幫寫的应结。后來(lái)刨疼，隨著高通量測(cè)序成本的降低...
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實(shí)驗(yàn)技術(shù)（1）——載體構(gòu)建相關(guān)常規(guī)載體構(gòu)建原理及流程較為簡(jiǎn)單，具體操作也比較容易鹅龄。這里進(jìn)行簡(jiǎn)單總結(jié)揩慕，并對(duì)幾點(diǎn)需要注意的點(diǎn)進(jìn)行說(shuō)明。 原理依賴于限制性核酸內(nèi)切酶扮休，DNA連接酶和其他修飾酶的作用漩绵，分別對(duì)目的基...
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決定用四年的時(shí)間記錄自己的成長(zhǎng)；<br>女孩子也可以努力的很漂亮宝踪；<br>喜歡的東西都很貴侨糟，所以要加油呀。<br>VX公共號(hào)：學(xué)生菌口替代表
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RT-PCR瘩燥，QRT-PCR秕重，real-timePCR之間的區(qū)別
PCR：一種快速的DNA復(fù)制方法,由變性--退火(復(fù)性）--延伸三個(gè)基本反應(yīng)步驟構(gòu)成。 RT-PCR：反轉(zhuǎn)錄baiPCR(reverse transcription-PCR)...
