一 基礎(chǔ)知識(shí) 1、什么是富集分析? 富集分析的原理一個(gè)生物過(guò)程通常是由一組基因共同參與沃但,而不是由單個(gè)基因獨(dú)自完成斗幼。富集分析的基本前提假設(shè)是两残,如果一個(gè)生物學(xué)過(guò)程在已知的研究中發(fā)...

一 基礎(chǔ)知識(shí) 1、什么是富集分析? 富集分析的原理一個(gè)生物過(guò)程通常是由一組基因共同參與沃但,而不是由單個(gè)基因獨(dú)自完成斗幼。富集分析的基本前提假設(shè)是两残,如果一個(gè)生物學(xué)過(guò)程在已知的研究中發(fā)...
參考文獻(xiàn):Confronting false discoveries in single-cell differential expression[https://doi.o...
增 R語(yǔ)言的索引是從1開(kāi)始的 當(dāng)我們?cè)L問(wèn)不存在的索引的時(shí)候轩性,他不會(huì)報(bào)錯(cuò)声登,而是以NA代替,類(lèi)似于python里面的None,大家注意比較一下揣苏!在這里悯嗓,我直接為索引為5的元素賦值...
以下內(nèi)容都是基于Christopher P. Randle教授在研究組上交流時(shí)的課件整理而來(lái)脯厨。 最大似然法選擇的最優(yōu)樹(shù)是使得觀察到的性狀分布(character state ...
一合武、什么是泛基因組? 2005年涡扼,Tettelin等人提出了微生物泛基因組概念(pangenome眯杏,pan源自希臘語(yǔ)‘παν’,全部的意思)壳澳,泛基因組即。2009 年茫经,Li等...
簡(jiǎn)寫(xiě) RPKM: Reads Per Kilobase of exon model per Million mapped reads (每千個(gè)堿基的轉(zhuǎn)錄每百萬(wàn)映射讀取的rea...
RPKM,F(xiàn)PKM和TPM明確解釋| RNA-Seq博客 來(lái)自StatQuest 過(guò)去铃彰,當(dāng)您進(jìn)行RNA測(cè)序時(shí)绍豁,您以RPKM(Reads Per Kilobase Millio...
接觸全基因組關(guān)聯(lián)分析(GWAS)已經(jīng)一年半有余竹揍,從剛開(kāi)始對(duì)GWAS的全然無(wú)知到現(xiàn)在慢慢了解,越來(lái)越能體會(huì)到這項(xiàng)技術(shù)的了不起邪铲。同時(shí)芬位,越來(lái)越多的科研工作者也在使用這項(xiàng)技術(shù),然后就...
作為一個(gè)已經(jīng)在生物信息行業(yè)摸爬兩年的小白带到,還是有必要重新認(rèn)識(shí)一下高通量測(cè)序領(lǐng)域的一些常用名詞昧碉。什么是高通量測(cè)序?高通量測(cè)序技術(shù)(High-throughput sequenc...
在碩士就讀期間阴孟,就已經(jīng)做過(guò) GWAS 相關(guān)的分析晌纫。當(dāng)時(shí)標(biāo)記量非常少, windows 系統(tǒng)分析就足夠了永丝,作圖方面涉及的腳本也基本是蔡師兄幫寫(xiě)的锹漱。后來(lái),隨著高通量測(cè)序成本的降低...
常規(guī)載體構(gòu)建原理及流程較為簡(jiǎn)單慕嚷,具體操作也比較容易哥牍。這里進(jìn)行簡(jiǎn)單總結(jié),并對(duì)幾點(diǎn)需要注意的點(diǎn)進(jìn)行說(shuō)明喝检。 原理依賴(lài)于限制性核酸內(nèi)切酶嗅辣,DNA連接酶和其他修飾酶的作用,分別對(duì)目的基...
PCR:一種快速的DNA復(fù)制方法,由變性--退火(復(fù)性)--延伸三個(gè)基本反應(yīng)步驟構(gòu)成。 RT-PCR:反轉(zhuǎn)錄baiPCR(reverse transcription-PCR)...