關(guān)于基因組組裝的流程可以參考我的簡(jiǎn)書(shū):http://www.reibang.com/p/e02ecd537c83 前面介紹了SOAPdenovo2的使用惑折，但是由于結(jié)果整體不...
發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：北京
-
基因組組裝----SPAdes(一)
-
相分離——目標(biāo)蛋白引物設(shè)計(jì)（OE plasmid的構(gòu)建）瞬轉(zhuǎn)目標(biāo)蛋白DNA勾邦，使其在細(xì)胞中瞬時(shí)高表達(dá)价涝，在熒光顯微鏡下觀察是否會(huì)形成聚合物顆粒漫拭。 1 蛋白表達(dá)質(zhì)粒構(gòu)建 （1）將自己的目標(biāo)蛋白們的CDS區(qū)的DNA序列導(dǎo)入primer 5...
-
pymol：使用腳本對(duì)蛋白互作結(jié)合分析圖（蛋白--蛋白對(duì)接）在我們進(jìn)行化學(xué)信息學(xué)相關(guān)的研究時(shí)，通過(guò)Autodock、schrodinger、Discover studio尊浓、MOE、ZDOCK等CADD軟件進(jìn)行蛋白蛋白互作時(shí)纯衍，通常需要對(duì)...
-
第6章：抗體多樣性2021-04-17導(dǎo)讀 人體似乎能夠產(chǎn)生無(wú)限量的抗體(免疫球蛋白[Ig])分子-也許宇宙中的每個(gè)抗原至少有一個(gè)栋齿！計(jì)算表明，人類抗體庫(kù)中可能有多達(dá)10^11種不同的抗體分子可用，這些抗體具有不同...
-
SWISS-MODEL蛋白模板和建模一個(gè)獲取蛋白模板和建模的方法：SWISS-MODEL 官網(wǎng)：https://swissmodel.expasy.org/[https://swissmodel.expasy....
-
使用alphafold2探索Covid19-Δ毒株新藥作用靶點(diǎn)的研究Covid19-delta毒株引起的疫情搞得大家人心惶惶瓦堵，作為一名科學(xué)研究人員基协，自然希望為疫情的控制盡一份力。寫(xiě)這篇帖子是為了將最新開(kāi)發(fā)的alphafold2和Covid19...
-
人工智能AlphaFold預(yù)測(cè)2.14億蛋白結(jié)構(gòu)蛋白質(zhì)是生命的基石谷丸，由氨基酸鏈組成堡掏，并折疊成復(fù)雜的形狀应结。由于蛋白質(zhì)的形狀與其功能密切相關(guān)刨疼，因此，了解蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)可以更好地了解其作用和工作原理鹅龄，這也是解決許多生命科學(xué)問(wèn)題的關(guān)...
-
推薦文章：http://www.reibang.com/p/5af9293297ea ------------------------------------------------------------ 視編程為愛(ài)好扮休，歡迎各類充滿熱情的編程技術(shù)分享迎卤。Python、C/C++玷坠、Java蜗搔、Spring、.Net Framework八堡、嵌入式樟凄、機(jī)電一體化所有和編程相關(guān)的內(nèi)容都?xì)g迎。 知識(shí)星球：https://t.zsxq.com/2ZfeAMN 公眾號(hào)：亖的 side4u 企鵝群：470100934 點(diǎn)擊鏈接加入群聊【編程直播室】：https://jq.qq.com/?_wv=1027&k=5w1pJpY
-
-
核小體和組蛋白修飾的作用B站視頻：復(fù)習(xí)：生化——核酸（1） - 知乎 (zhihu.com)[https://zhuanlan.zhihu.com/p/103809301] 核小體：真核生物DNA以...
-
基于免疫原性細(xì)胞死亡基因進(jìn)行腫瘤分型，發(fā)表8+純生信挂谍。文章蹭上熱點(diǎn)就可以事半功倍叔壤！生信小課堂 影響因子：8.786 本文屬于單腫瘤分型思路，類似的分型文章我們也解讀過(guò)很多口叙。 腫瘤分型文章比較重要的結(jié)論就是分型后構(gòu)建的評(píng)分能夠預(yù)測(cè)免疫治療或者其他治療的療效炼绘。...
-
細(xì)胞系cell line相關(guān)數(shù)據(jù)庫(kù)CLO（Cell Line Ontology） http://www.clo-ontology.org/index.php[http://www.clo-ontology.o...
-
Meta分析軟件盤(pán)點(diǎn)，做Meta要用哪些軟件妄田？含meta分析軟件安裝包饭望！書(shū)接上回，之前我們?cè)凇秏eta分析的基本步驟是什么形庭？附實(shí)例講解铅辞，7步快速見(jiàn)刊策略》文章里詳細(xì)給大家介紹了撰寫(xiě)一篇Meta分析需要經(jīng)過(guò)哪些步驟。 今天我們就從這些步驟入手萨醒，給大...
-
7.7分nature子刊斟珊，單基因泛癌分析與免疫治療的關(guān)聯(lián)大家好，今天要和大家分享的是2021年6月發(fā)表的一篇文章：“Pan-cancer analysis of SETD2 mutation and its association...
-
8.4分非腫瘤生信，免疫浸潤(rùn)+機(jī)器學(xué)習(xí)+動(dòng)物模型驗(yàn)證囤踩≈冀罚可謂是非腫瘤生信結(jié)合實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證的范文，值得收藏堵漱！生信小課堂 影響因子：8.44 關(guān)于非腫瘤生信综慎，我們也解讀過(guò)很多，主要有以下類型 1 單個(gè)疾病WGCNA+PPI分析篩選hub基因勤庐。2 單個(gè)疾病結(jié)合免疫浸潤(rùn)示惊，鐵死亡，自噬等基...
-
[基因序列]序列比對(duì)專題
探序基因腫瘤研究院整理[https://cancer.tanxugene.cn] 1. BWA比對(duì)fastq測(cè)序序列 bwa mem -t 16 /xxx/database/...
-
基因組組裝----SOAPdenovo21.基因組組裝的流程 基因組組裝的大概流程如下： (1) 測(cè)序得到raw reads序列愉镰。 (2) Reads質(zhì)量評(píng)估米罚。 (3) 原始reads質(zhì)控。 (4) 選擇合適的參數(shù)...
-
Linux | Conda安裝及環(huán)境搭載-101conda是什么 Anaconda 是一個(gè)用于科學(xué)計(jì)算的 Python 發(fā)行版丈探，支持 Linux, Mac, Windows, 包含了眾多流行的科學(xué)計(jì)算录择、數(shù)據(jù)分析的 Pyth...
-
細(xì)菌基因組拼接工具比較（二）2021.3.18持續(xù)更新中。碗降。隘竭。目的：比較下目前常用的四款拼接軟件：Velvet、SPAdes讼渊、SOAPdenovo动看、ABySS 1. FastQC —— 質(zhì)量評(píng)估 Fas...
