第一張圖里的相關(guān)性是按照樣本類型劃分的堤框，再算的吧替蔬，跟下面的代碼好像不一樣唉。
不同單細(xì)胞群之間的相關(guān)性分析單細(xì)胞繪圖系列： Seurat繪圖函數(shù)總結(jié)[http://www.reibang.com/p/95e61f7e834d] 使用ggplot2優(yōu)化Seurat繪圖[https...
發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：香港
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作者沒有直接注釋出細(xì)胞類型嗎入桂？
文獻(xiàn)學(xué)習(xí)107-IL-1β+ macrophages fuel pathogenic inflammation in pancreatic cancer
1. Identification of IL-1β+ TAMs in PDAC Fig 1a-c： 作者對(duì)新鮮分離的來(lái)自naive 或 chemotherapy treat...
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多組織樣本可以匯集到一起嗎十厢？
ChromHMM： 染色體狀態(tài)的分類
前言 ??時(shí)間過(guò)的真快糊渊，一轉(zhuǎn)眼距離上一次發(fā)帖已經(jīng)過(guò)去兩周的時(shí)間谅阿，不知道這兩周時(shí)間自己都忙了些啥，時(shí)間就沒有了溉苛。真的是越窮越忙镜廉，越忙越窮啊愚战！ ??上周測(cè)試了一個(gè)軟件——Chro...
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echo娇唯、print_r、print寂玲、var_dump之間的區(qū)別
echo塔插、print是php語(yǔ)句，var_dump和print_r是函數(shù) echo 輸出一個(gè)或多個(gè)字符串拓哟，中間以逗號(hào)隔開想许，沒有返回值是語(yǔ)言結(jié)構(gòu)而不是真正的函數(shù)，因此不能作為表...
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@fatlady 是文件里的断序，那個(gè)文件好像是個(gè)腳本吧流纹。
差異表達(dá)基因檢測(cè) | EBSeq
寫在前面 要幫朋友做RNA-seq的分析，cases vs. controls總共4個(gè)樣本（2 vs. 2)违诗，看到文獻(xiàn)（實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)比較類似）里用的是EBSeq較為頻繁漱凝，所以用這...
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@fatlady 嗯嗯，一共三行指令還有非法字符诸迟，我看了一個(gè)人的方法是將含有非法字符的指令內(nèi)容都去掉即可茸炒，但是我試了沒有成功。
差異表達(dá)基因檢測(cè) | EBSeq
寫在前面 要幫朋友做RNA-seq的分析亮蒋，cases vs. controls總共4個(gè)樣本（2 vs. 2)扣典，看到文獻(xiàn)（實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)比較類似）里用的是EBSeq較為頻繁妆毕，所以用這...
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@taoyan 數(shù)據(jù)沒問(wèn)題慎玖，之前添加P值時(shí)候用的是anova的方法，結(jié)果得到的三個(gè)P值都是一樣的笛粘，我換了t.test的方法得到的結(jié)果和單獨(dú)anova檢驗(yàn)是的結(jié)果一樣了趁怔。
R語(yǔ)言可視化學(xué)習(xí)筆記之添加p-value和顯著性標(biāo)記
上篇文章中提了一下如何通過(guò)ggpubr包為ggplot圖添加p-value以及顯著性標(biāo)記,本文將詳細(xì)介紹湿硝。利用數(shù)據(jù)集ToothGrowth進(jìn)行演示 比較方法 R中常用的比較方...
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你好，請(qǐng)問(wèn)我將報(bào)錯(cuò)文件中的無(wú)法識(shí)別字符刪除了還是報(bào)錯(cuò)润努，可能的原因有什么关斜。
差異表達(dá)基因檢測(cè) | EBSeq
寫在前面 要幫朋友做RNA-seq的分析，cases vs. controls總共4個(gè)樣本（2 vs. 2)铺浇，看到文獻(xiàn)（實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)比較類似）里用的是EBSeq較為頻繁痢畜，所以用這...
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您好，我在給小提琴圖添加P值時(shí)遇到一個(gè)問(wèn)題鳍侣，我的樣本組有三組丁稀，使用ggpubr計(jì)算P值后得到三個(gè)P值都是一樣的，可能時(shí)什么原因造成這種情況呢倚聚。
R語(yǔ)言可視化學(xué)習(xí)筆記之添加p-value和顯著性標(biāo)記
上篇文章中提了一下如何通過(guò)ggpubr包為ggplot圖添加p-value以及顯著性標(biāo)記,本文將詳細(xì)介紹线衫。利用數(shù)據(jù)集ToothGrowth進(jìn)行演示 比較方法 R中常用的比較方...
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數(shù)量生態(tài)學(xué)筆記||非約束排序||PCoA主坐標(biāo)分析（Principal Coordinates Analysis ,PCoA, =Classical Multidimensional Scaling ，cMDSca...
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本科畢業(yè)于浙江大學(xué)，碩士畢業(yè)于復(fù)旦大學(xué)惨驶，浙大讀博ing白热。<br>如果沒有及時(shí)回復(fù)可以發(fā)送郵件：jlyq617@gmail.com
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Qiime1-16.LEfSe輸入文件如何生成？如何使用LEfSe敞咧？今天我們要來(lái)介紹在16S分析中經(jīng)常用到的另一個(gè)在線分析工具LEfSe棘捣。該工具是由Huttenhower小組開發(fā)的，用于通過(guò)相對(duì)豐度來(lái)發(fā)現(xiàn)2個(gè)或更多個(gè)組之間的生物標(biāo)記休建。本節(jié)主要...
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Alpha多樣性【轉(zhuǎn)】
Alpha多樣性是指一個(gè)特定區(qū)域或生態(tài)系統(tǒng)內(nèi)的多樣性乍恐，是反映豐富度和均勻度的綜合指標(biāo)。Alpha多樣性主要與兩個(gè)因素有關(guān)：一是種類數(shù)目测砂，即豐富度茵烈；二是多樣性，群落中個(gè)體分配上...
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北京基因組所研究生在讀，實(shí)驗(yàn)&生信小蝸牛一只存璃。歡迎一起討論呀~ <br>liulinli17m@big.ac.cn
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BBQ(生物信息基礎(chǔ)問(wèn)題35仑荐，36)：RNA-Seq 數(shù)據(jù)的定量之RPKM，F(xiàn)PKM和TPM??在討論RNA-seq相關(guān)方法的時(shí)候纵东，我們有一個(gè)基本的假設(shè)粘招。就是說(shuō)我們對(duì)細(xì)胞/組織/個(gè)體的不同狀態(tài)進(jìn)行比較，然后就是為了尋找到差異表達(dá)的基因偎球。然后從差異表達(dá)的基因去推測(cè)其生...
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讀書專題收錄與讀書有關(guān)的書評(píng)、讀書筆記袍冷、閱讀方法磷醋、讀書清單等文章 文中不得出現(xiàn)推廣鏈接；包括但不限于公眾號(hào)胡诗、頭條號(hào)邓线、二維碼、微博等帶有廣告性質(zhì)的信息煌恢；配圖不能帶有水文褂痰。 請(qǐng)不要直接抄襲原文來(lái)投稿。請(qǐng)注意排版美觀症虑、內(nèi)容結(jié)構(gòu)完整缩歪、內(nèi)容豐富、富有內(nèi)涵等谍憔，注意不要密集投稿匪蝙！ 投稿須知：http://www.reibang.com/p/92d97be1a133
