第一張圖里的相關(guān)性是按照樣本類型劃分的，再算的吧蛹屿，跟下面的代碼好像不一樣唉瓜晤。
不同單細(xì)胞群之間的相關(guān)性分析單細(xì)胞繪圖系列： Seurat繪圖函數(shù)總結(jié)[http://www.reibang.com/p/95e61f7e834d] 使用ggplot2優(yōu)化Seurat繪圖[https...
發(fā)簡信
IP屬地：香港
-
-
作者沒有直接注釋出細(xì)胞類型嗎夺欲？
文獻(xiàn)學(xué)習(xí)107-IL-1β+ macrophages fuel pathogenic inflammation in pancreatic cancer
1. Identification of IL-1β+ TAMs in PDAC Fig 1a-c： 作者對新鮮分離的來自naive 或 chemotherapy treat...
-
多組織樣本可以匯集到一起嗎柑贞？
ChromHMM： 染色體狀態(tài)的分類
前言 ??時間過的真快雳灾，一轉(zhuǎn)眼距離上一次發(fā)帖已經(jīng)過去兩周的時間筷笨，不知道這兩周時間自己都忙了些啥仍翰，時間就沒有了赫粥。真的是越窮越忙，越忙越窮坝杞琛越平！ ??上周測試了一個軟件——Chro...
-
echo、print_r灵迫、print秦叛、var_dump之間的區(qū)別
echo、print是php語句瀑粥，var_dump和print_r是函數(shù) echo 輸出一個或多個字符串挣跋，中間以逗號隔開，沒有返回值是語言結(jié)構(gòu)而不是真正的函數(shù)狞换，因此不能作為表...
-
@fatlady 是文件里的避咆，那個文件好像是個腳本吧。
差異表達(dá)基因檢測 | EBSeq
寫在前面 要幫朋友做RNA-seq的分析修噪，cases vs. controls總共4個樣本（2 vs. 2)查库，看到文獻(xiàn)（實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)比較類似）里用的是EBSeq較為頻繁，所以用這...
-
@fatlady 嗯嗯黄琼，一共三行指令還有非法字符樊销，我看了一個人的方法是將含有非法字符的指令內(nèi)容都去掉即可，但是我試了沒有成功脏款。
差異表達(dá)基因檢測 | EBSeq
寫在前面 要幫朋友做RNA-seq的分析围苫，cases vs. controls總共4個樣本（2 vs. 2)，看到文獻(xiàn)（實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)比較類似）里用的是EBSeq較為頻繁弛矛，所以用這...
-
@taoyan 數(shù)據(jù)沒問題够吩，之前添加P值時候用的是anova的方法，結(jié)果得到的三個P值都是一樣的丈氓，我換了t.test的方法得到的結(jié)果和單獨(dú)anova檢驗(yàn)是的結(jié)果一樣了周循。
R語言可視化學(xué)習(xí)筆記之添加p-value和顯著性標(biāo)記
上篇文章中提了一下如何通過ggpubr包為ggplot圖添加p-value以及顯著性標(biāo)記,本文將詳細(xì)介紹强法。利用數(shù)據(jù)集ToothGrowth進(jìn)行演示 比較方法 R中常用的比較方...
-
你好，請問我將報(bào)錯文件中的無法識別字符刪除了還是報(bào)錯湾笛，可能的原因有什么饮怯。
差異表達(dá)基因檢測 | EBSeq
寫在前面 要幫朋友做RNA-seq的分析，cases vs. controls總共4個樣本（2 vs. 2)嚎研，看到文獻(xiàn)（實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)比較類似）里用的是EBSeq較為頻繁蓖墅，所以用這...
-
您好，我在給小提琴圖添加P值時遇到一個問題临扮，我的樣本組有三組论矾，使用ggpubr計(jì)算P值后得到三個P值都是一樣的，可能時什么原因造成這種情況呢杆勇。
R語言可視化學(xué)習(xí)筆記之添加p-value和顯著性標(biāo)記
上篇文章中提了一下如何通過ggpubr包為ggplot圖添加p-value以及顯著性標(biāo)記,本文將詳細(xì)介紹贪壳。利用數(shù)據(jù)集ToothGrowth進(jìn)行演示 比較方法 R中常用的比較方...
-
數(shù)量生態(tài)學(xué)筆記||非約束排序||PCoA主坐標(biāo)分析（Principal Coordinates Analysis ,PCoA, =Classical Multidimensional Scaling ，cMDSca...
-
本科畢業(yè)于浙江大學(xué)，碩士畢業(yè)于復(fù)旦大學(xué)钻注，浙大讀博ing蚂且。<br>如果沒有及時回復(fù)可以發(fā)送郵件：jlyq617@gmail.com
-
Qiime1-16.LEfSe輸入文件如何生成？如何使用LEfSe幅恋？今天我們要來介紹在16S分析中經(jīng)常用到的另一個在線分析工具LEfSe杏死。該工具是由Huttenhower小組開發(fā)的，用于通過相對豐度來發(fā)現(xiàn)2個或更多個組之間的生物標(biāo)記捆交。本節(jié)主要...
-
Alpha多樣性【轉(zhuǎn)】
Alpha多樣性是指一個特定區(qū)域或生態(tài)系統(tǒng)內(nèi)的多樣性识埋，是反映豐富度和均勻度的綜合指標(biāo)。Alpha多樣性主要與兩個因素有關(guān)：一是種類數(shù)目零渐，即豐富度窒舟；二是多樣性，群落中個體分配上...
-
北京基因組所研究生在讀，實(shí)驗(yàn)&生信小蝸牛一只风宁。歡迎一起討論呀~ <br>liulinli17m@big.ac.cn
-
BBQ(生物信息基礎(chǔ)問題35洁墙，36)：RNA-Seq 數(shù)據(jù)的定量之RPKM，F(xiàn)PKM和TPM??在討論RNA-seq相關(guān)方法的時候戒财，我們有一個基本的假設(shè)热监。就是說我們對細(xì)胞/組織/個體的不同狀態(tài)進(jìn)行比較，然后就是為了尋找到差異表達(dá)的基因饮寞。然后從差異表達(dá)的基因去推測其生...
-
