1.青梅選用表皮光滑，有色澤的，大概500g（一斤）即可孤钦。洗凈，裝好界阁。 2.在洗凈的青梅上倒入200g食鹽萍倡，進行適當?shù)臄嚢杪タ取榱烁玫爻タ酀奈兜朗彻眩瑪嚢韬笮桦缰破蹋?0分...
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我很懶伤为，但是我很可愛~~
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01LaTeX學習系列之---TeX的介紹與認識
01TeX的介紹與認識 目錄 本系列是有關LaTeX的學習系列便脊，共計19篇蚂四，本章節(jié)是第1篇光戈。前一篇：無后一篇：02LaTeX學習系列之---TeX環(huán)境的搭建總目錄：19LaT...
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測序原理：一代二代三代測序原理詳解1. 一代測序(Sanger sequencing) 雙脫氧鏈終止法采用DNA復制原理。 Sanger測序反應體系中包括目標DNA片段遂赠、脫氧三磷酸核苷酸（dNTP）久妆、雙脫氧三...
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火起來的“相分離”是什么？相分離或者說相變（Phase separation跷睦，Phase Transition）是目前比較火的一個研究領域筷弦，已有的研究表明相分離在細胞中普遍存在，與基因組的組裝抑诸、轉錄調...
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【三代】淺談三代測序平臺2011年烂琴，美國Pacific Biosciences 公司正式發(fā)售第三代測序系統(tǒng)—PacBio RS。這是一臺革命性的DNA測序系統(tǒng)蜕乡，它融合了新穎的單分子測序技術和高級的分...
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TCGA FPKM 轉化為 TPM
FPKM 一般來說不太好用奸绷，轉為TPM進行后續(xù)的分析比較合適。下面是FPKM轉化為TPM的R實現(xiàn)： 參考： RNA-Seq的Counts和FPKM數(shù)據(jù)如何轉換成TPM层玲？[ht...
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RNA-Seq分析|RPKM, FPKM, TPM, 計算對比在高通量測序當中号醉，很重要的一塊就是檢測基因的表達量，它是差異分析和轉錄組數(shù)據(jù)分析的基礎辛块。與q-PCR相似畔派，基因表達量的衡量也是采取相對定量的方法。落在一個基因區(qū)域內的read...
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RPKM, FPKM, TPM
什么是測序深度和測序覆蓋度 測序深度（depth）是指測序得到的總堿基數(shù)與待測基因組大小的比值润绵，可以理解為基因組中每個堿基被測序到的平均次數(shù)线椰。測序深度 = reads長度 ×...
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轉錄組入門(6)： reads計數(shù)要求 實現(xiàn)這個功能的軟件也很多娇澎，還是煩請大家先自己搜索幾個教程笨蚁，入門請統(tǒng)一用htseq-count，對每個樣本都會輸出一個表達量文件。需要用腳本合并所有的樣本為表達矩陣括细。參考...
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搜索功能基因的假基因
假基因（pseudogene） 假基因也叫偽基因奋单，是基因家族在進化過程中形成的無功能的殘留物锉试。假基因與正常基因序列高度相似览濒，但喪失正常功能呆盖，一般情況都不被轉錄，且沒有明確生理...
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Linux基本命令分類
目錄 Linux基本命令 一贷笛、文件基本操作命令 1. ls命令 2. pwd命令 3. mkdir命令 4. cd命令 5. touch命令 6. cp命令 7. mv命...
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grep及正則表達式
grep应又，egrep ，fgrep grep [options] 'PATTERN' [FILES] 選項 -i 乏苦，忽略字母大小寫 選項 --color株扛，匹配出的字符串加色顯...
