重建系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系=分子數(shù)據(jù)建樹(shù)徙瓶? 一提到phylogeny,我們的第一反應(yīng)就是分子數(shù)據(jù)建樹(shù)寓落。這種理解是片面的,但也反映了一些它的分類(lèi)學(xué)的區(qū)別: 首先,分類(lèi)學(xué)在根據(jù)charac...
本文具體介紹生物信息學(xué)分析中最常用的群體結(jié)構(gòu)展示圖形——系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)室琢,分為兩部分進(jìn)行說(shuō)明:系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)的基本概念和系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)的構(gòu)建乾闰。 全文重點(diǎn): 第一部分 系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)是描述物種間...
最近看了幾篇關(guān)于共線(xiàn)性分析的微信/簡(jiǎn)書(shū)推送铅乡,發(fā)現(xiàn)不少研究人員把“編碼基因共線(xiàn)性”錯(cuò)誤地描述為“全基因組共線(xiàn)性”。這是兩個(gè)完全不同的概念烈菌,前者主要是基于蛋白水平阵幸,蛋白的保守性很...
今天分享DNA測(cè)序技術(shù)和原理花履,包括illumina和pacbio測(cè)序原理、基本介紹和優(yōu)缺點(diǎn)對(duì)比挚赊。 Illumina測(cè)序技術(shù) 原理:邊合成邊測(cè)序 測(cè)序長(zhǎng)度:150bp 通量:6...
這篇教程是我在2019年9月左右分析WGD時(shí)的筆記诡壁。目前來(lái)看,背景介紹和軟件使用說(shuō)明都基本沒(méi)啥問(wèn)題荠割。但是現(xiàn)在更建議大家使用wgdi進(jìn)行比較基因組學(xué)中相關(guān)分析妹卿,教程見(jiàn)如何用WG...