問題 怎么去doublet？挑選出某一大類做小類降維聚類的時候，有人仍然會檢查一下各種大類marker的表達(dá)情況斩芭，這一步是否有必要框全？ 1 最有效的方法還是從上游入手只估，控制細(xì)胞...
IP屬地：北京
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答讀者問(7)：關(guān)于doublet
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我使用了scrublet和doubletfinder兩種方法吠冤，發(fā)現(xiàn)結(jié)果差別非常大相味，預(yù)測的doublet很少有重合的尼酿，請問您遇到過這種情況嗎爷狈？您有好的建議嗎？可以付費咨詢您嗎裳擎？
答讀者問(7)：關(guān)于doublet
問題 怎么去doublet涎永？挑選出某一大類做小類降維聚類的時候，有人仍然會檢查一下各種大類marker的表達(dá)情況鹿响，這一步是否有必要羡微？ 1 最有效的方法還是從上游入手，控制細(xì)胞...
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@凌川美兮 應(yīng)該不是启涯，我是導(dǎo)入的一個差異基因列表，按理說總不能所有基因表達(dá)都具有相關(guān)性吧??
TCGA數(shù)據(jù)差異分析后生存分析（批量單因素cox回歸/Lasso篩選恃轩，多因素cox建模结洼，時間依賴ROC曲線及KM plot可視化）
測序上游分析系列： mRNA-seq轉(zhuǎn)錄組二代測序從raw reads到表達(dá)矩陣：上中游分析pipelinemiRNA-seq小RNA高通量測序pipeline：從raw r...
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我和你恰好相反，我的全部過濾完了??
TCGA數(shù)據(jù)差異分析后生存分析（批量單因素cox回歸/Lasso篩選叉跛，多因素cox建模松忍，時間依賴ROC曲線及KM plot可視化）
測序上游分析系列： mRNA-seq轉(zhuǎn)錄組二代測序從raw reads到表達(dá)矩陣：上中游分析pipelinemiRNA-seq小RNA高通量測序pipeline：從raw r...
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TCGA
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2021-07-31 細(xì)胞焦亡程序性細(xì)胞死亡(Programmed Cell Death, PCD)，是指細(xì)胞接受某種信號或受到某些因素刺激后摊溶，為了維持內(nèi)環(huán)境穩(wěn)定而發(fā)生的一種主動性消亡過程爬骤。凋亡、自噬莫换、細(xì)...
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SCTransform：單細(xì)胞樣本的標(biāo)準(zhǔn)化Seurat從3.0版本引進(jìn)了SCTransform這個函數(shù)用來對數(shù)據(jù)做標(biāo)準(zhǔn)化霞玄，并且這一個函數(shù)可以代替三個函數(shù)（NormalizeData, ScaleData, FindV...
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10X單細(xì)胞（10X空間轉(zhuǎn)錄組）TCR（BCR）數(shù)據(jù)分析之洛倫茲曲線和ball-packing plotshello喊暖，大家好惫企，今天我們學(xué)習(xí)一些簡單的內(nèi)容，關(guān)于我們單細(xì)胞測序得到的TCR陵叽、BCR分析得到的數(shù)據(jù)如何進(jìn)行良好的展示雅任，我們來看看下面的分析部分。參考文章為Single-ce...
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生信阿拉丁硼婿，為實用而生
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這個世界流行離開寇漫，但我們卻不擅長告別
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總結(jié)的真的太好了刊殉，請問能分享一下參考文獻(xiàn)來源嗎？非常感謝
基質(zhì)細(xì)胞的注釋
成纖維細(xì)胞： The first CAF sub-cluster was comprised of 280 cells (16.2% of all stromal; red ...
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基質(zhì)細(xì)胞的注釋
成纖維細(xì)胞： The first CAF sub-cluster was comprised of 280 cells (16.2% of all stromal; red ...
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單細(xì)胞測序技術(shù)與數(shù)據(jù)分析
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不看私信<br>看不到的文章是被簡書鎖了
