作者叶堆,Evil Genius~~~ 今天不想看文章了痹筛,我們來畫一畫圖吧。 單細胞的我們來畫一畫下面的圖 空間的部分我們來畫一畫鄰域網(wǎng)絡圖 注意空間圖的注釋 Neighbor...
![240](https://cdn2.jianshu.io/assets/default_avatar/11-4d7c6ca89f439111aff57b23be1c73ba.jpg?imageMogr2/auto-orient/strip|imageView2/1/w/240/h/240)
作者叶堆,Evil Genius~~~ 今天不想看文章了痹筛,我們來畫一畫圖吧。 單細胞的我們來畫一畫下面的圖 空間的部分我們來畫一畫鄰域網(wǎng)絡圖 注意空間圖的注釋 Neighbor...
前言 嗨嘍,大家好呀~這里是愛看美女的茜茜吶 又到了學Python時刻~ 每逢春節(jié),無論城市還是農(nóng)村氮帐, 家家戶戶都要挑漂亮的紅春聯(lián)貼于門上,辭舊迎新洛姑,增加喜慶的節(jié)日氣氛上沐。 據(jù)...
@單細胞空間交響樂 太貴了…買不起。
細胞注釋之marker列表最近一段時間更新的少楞艾,是因為自己搜集經(jīng)典marker的工作接近尾聲了参咙,所以花了比較長的時間整理和總結,我自己拿了幾個數(shù)據(jù)測試了一下硫眯,基本上效果不錯蕴侧,用搜集到的marker配合...
還能有marker表下載嗎???
細胞注釋之marker列表最近一段時間更新的少两入,是因為自己搜集經(jīng)典marker的工作接近尾聲了净宵,所以花了比較長的時間整理和總結,我自己拿了幾個數(shù)據(jù)測試了一下,基本上效果不錯择葡,用搜集到的marker配合...
在我們之前的分享中紧武,已經(jīng)分享過很多的單細胞和空間聯(lián)合分析的方法,有關Spotlight敏储,之前也提到過阻星,但是并沒有很認真的對關注這個方法,這次的分享已添,就讓我們來參透這個方法妥箕;這...
輸入文件導入方法 Monocle擬時間導入數(shù)據(jù)方式有兩種云矫,一種是通過導入Seurat對象岳悟,一種是導入cellranger輸出的表達矩陣(三個文件barcodes.tsv g...
請問這個方法轉換的對象,features數(shù)目是否和原來差異較大?我嘗試自己過濾數(shù)據(jù)后進行構建對象贵少,構建完的結果評估features和原本評估的差異很大呵俏,幾乎少了近一半√显睿可能是什么原因導致的呢普碎?
非10X單細胞測序數(shù)據(jù)創(chuàng)建Seurat對象CreateSeuratObjectSeurat可以直接讀取10X數(shù)據(jù),網(wǎng)上也有很多緊跟潮流的相關教程录平,但是非10X的數(shù)據(jù)怎么讀入呢麻车?很簡單~ 首先讀入txt文件,轉成table斗这;生成matrix矩陣动猬,再轉成s...
請問質控的時候出現(xiàn)結果全是NA是什么原因?我的data frame在沒有l(wèi)og2轉換的時候表箭,細胞層面的質控全是NA赁咙,在轉換后細胞和基因層面的結果全是NA。一直沒能找到原因免钻。彼水。。
10X scRNA免疫治療學習筆記-6-marker基因的表達量可視化劉小澤寫于19.10.18筆記目的:根據(jù)生信技能樹的單細胞轉錄組課程探索10X Genomics技術相關的分析課程鏈接在:http://jm.grazy.cn/index/m...
已經(jīng)做好了极舔,是cutoff值的問題凤覆,非常感謝。我在楓林校區(qū)這邊拆魏,不懂的地方還請多多指導盯桦。@jlyq617
GenVisR包:突變類型不在waterfall函數(shù)指定范圍?GenVisR包是一個用于基因組可視化的包渤刃。為我們提供了多種用于展示基因組突變拥峦、基因突變等圖像,包括我們熟知的基因突變瀑布圖等溪掀。今天介紹該包中的waterfall函數(shù)功能事镣。 ...
同學你好,我跑了一個數(shù)據(jù)集揪胃,結果圖顯示左側瀑布圖一片模糊的色塊蓋上去了璃哟。應該怎么處理呢?
GenVisR包:突變類型不在waterfall函數(shù)指定范圍喊递?GenVisR包是一個用于基因組可視化的包随闪。為我們提供了多種用于展示基因組突變、基因突變等圖像骚勘,包括我們熟知的基因突變瀑布圖等铐伴。今天介紹該包中的waterfall函數(shù)功能撮奏。 ...
我只會用R,請問如何在Mac上運行呢当宴?
將ICGC的基因表達數(shù)據(jù)處理成表達矩陣(perl)小程序的目的 最近在搞ICGC的數(shù)據(jù)庫畜吊,想作為TCGA數(shù)據(jù)挖掘的驗證集,然后發(fā)現(xiàn)ICGC下下來的數(shù)據(jù)不能夠直接用于分析户矢,于是寫個小的perl處理了一下玲献,能夠分別輸出標準化過的...
能分享下資源嗎?百度好久都沒見
電影《Marriage Story》婚姻故事 英語筆記最近著名媒體綜合評分網(wǎng)站 Metacritic (MTC) 公布了「2010-2019年最佳電影 Top 50」梯浪,這里邊基本上都是當年的大熱門捌年,沒看過的大家可以補起來!不用再...
BLENDER是一款開源礼预、免費的多平臺、全能的三維動畫制作軟件虏劲。 Free to Use. Free to Change. Free to Share. Free to Se...
關注這問題很久了布疼,總覺得自己應該說點什么了!13年的從業(yè)經(jīng)驗告訴我币狠,不要再誤導初學者了...(此處廢話很多游两,不喜者繞道)本人從學習三維動畫技術到現(xiàn)在已經(jīng)整整13年了,算起來也...