作者，Evil Genius~~~ 今天不想看文章了臭增，我們來畫一畫圖吧狱掂。 單細胞的我們來畫一畫下面的圖 空間的部分我們來畫一畫鄰域網(wǎng)絡圖 注意空間圖的注釋 Neighbor...
發(fā)簡信
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空間細胞鄰域網(wǎng)絡圖 -
過年春聯(lián)不可少，python帶你制作春聯(lián)艺普，體驗不一樣的過年氛圍前言 嗨嘍，大家好呀~這里是愛看美女的茜茜吶 又到了學Python時刻~ 每逢春節(jié)，無論城市還是農(nóng)村灸异， 家家戶戶都要挑漂亮的紅春聯(lián)貼于門上，辭舊迎新羔飞，增加喜慶的節(jié)日氣氛肺樟。 據(jù)...
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@單細胞空間交響樂 太貴了…買不起。
細胞注釋之marker列表
最近一段時間更新的少逻淌，是因為自己搜集經(jīng)典marker的工作接近尾聲了么伯，所以花了比較長的時間整理和總結(jié)，我自己拿了幾個數(shù)據(jù)測試了一下卡儒，基本上效果不錯田柔，用搜集到的marker配合...
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還能有marker表下載嗎？??
細胞注釋之marker列表
最近一段時間更新的少骨望，是因為自己搜集經(jīng)典marker的工作接近尾聲了硬爆，所以花了比較長的時間整理和總結(jié)，我自己拿了幾個數(shù)據(jù)測試了一下擎鸠，基本上效果不錯缀磕，用搜集到的marker配合...
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10X單細胞空間聯(lián)合分析之三----Spotlight在我們之前的分享中，已經(jīng)分享過很多的單細胞和空間聯(lián)合分析的方法，有關Spotlight袜蚕，之前也提到過糟把，但是并沒有很認真的對關注這個方法，這次的分享牲剃，就讓我們來參透這個方法遣疯；這...
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這個世界流行離開缠犀，但我們卻不擅長告別
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公眾號：TOP生物信息<br>B站：TOP菌<br>WeChat：TOPJUN996<br><br>top2讀研夭坪，學習方向：癌癥基因組、腫瘤免疫过椎、單細胞組學
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周運來疚宇，男亡鼠，長大了才會遇到的帥哥，穩(wěn)健敷待，瀟灑间涵，大方，靠譜榜揖。一段生信緣勾哩，一棵技能樹。生信技能樹核心成員举哟，單細胞天地供稿人思劳，簡書創(chuàng)作者，單細胞數(shù)據(jù)科學家妨猩。
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如果不滿懷希望壶硅，那滿懷什么呢威兜！
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Monocle擬時間分析隨筆輸入文件導入方法 Monocle擬時間導入數(shù)據(jù)方式有兩種，一種是通過導入Seurat對象庐椒，一種是導入cellranger輸出的表達矩陣（三個文件barcodes.tsv g...
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請問這個方法轉(zhuǎn)換的對象椒舵，features數(shù)目是否和原來差異較大？我嘗試自己過濾數(shù)據(jù)后進行構(gòu)建對象约谈，構(gòu)建完的結(jié)果評估features和原本評估的差異很大笔宿，幾乎少了近一半犁钟。可能是什么原因?qū)е碌哪兀?
非10X單細胞測序數(shù)據(jù)創(chuàng)建Seurat對象CreateSeuratObject
Seurat可以直接讀取10X數(shù)據(jù)措伐，網(wǎng)上也有很多緊跟潮流的相關教程特纤，但是非10X的數(shù)據(jù)怎么讀入呢军俊？很簡單~ 首先讀入txt文件侥加，轉(zhuǎn)成table；生成matrix矩陣粪躬，再轉(zhuǎn)成s...
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請問質(zhì)控的時候出現(xiàn)結(jié)果全是NA是什么原因担败？我的data frame在沒有l(wèi)og2轉(zhuǎn)換的時候，細胞層面的質(zhì)控全是NA镰官，在轉(zhuǎn)換后細胞和基因?qū)用娴慕Y(jié)果全是NA提前。一直沒能找到原因。泳唠。狈网。
10X scRNA免疫治療學習筆記-6-marker基因的表達量可視化
劉小澤寫于19.10.18筆記目的：根據(jù)生信技能樹的單細胞轉(zhuǎn)錄組課程探索10X Genomics技術相關的分析課程鏈接在：http://jm.grazy.cn/index/m...
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已經(jīng)做好了，是cutoff值的問題笨腥，非常感謝拓哺。我在楓林校區(qū)這邊，不懂的地方還請多多指導脖母。@jlyq617
GenVisR包：突變類型不在waterfall函數(shù)指定范圍士鸥？
GenVisR包是一個用于基因組可視化的包。為我們提供了多種用于展示基因組突變谆级、基因突變等圖像烤礁，包括我們熟知的基因突變瀑布圖等。今天介紹該包中的waterfall函數(shù)功能肥照。 ...
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同學你好脚仔，我跑了一個數(shù)據(jù)集，結(jié)果圖顯示左側(cè)瀑布圖一片模糊的色塊蓋上去了舆绎。應該怎么處理呢玻侥？
GenVisR包：突變類型不在waterfall函數(shù)指定范圍？
GenVisR包是一個用于基因組可視化的包亿蒸。為我們提供了多種用于展示基因組突變凑兰、基因突變等圖像，包括我們熟知的基因突變瀑布圖等边锁。今天介紹該包中的waterfall函數(shù)功能姑食。 ...
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我只會用R，請問如何在Mac上運行呢茅坛？
將ICGC的基因表達數(shù)據(jù)處理成表達矩陣（perl）
小程序的目的 最近在搞ICGC的數(shù)據(jù)庫音半，想作為TCGA數(shù)據(jù)挖掘的驗證集则拷，然后發(fā)現(xiàn)ICGC下下來的數(shù)據(jù)不能夠直接用于分析，于是寫個小的perl處理了一下曹鸠，能夠分別輸出標準化過的...
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能分享下資源嗎煌茬？百度好久都沒見
電影《Marriage Story》婚姻故事 英語筆記
最近著名媒體綜合評分網(wǎng)站 Metacritic (MTC) 公布了「2010-2019年最佳電影 Top 50」，這里邊基本上都是當年的大熱門彻桃，沒看過的大家可以補起來坛善！不用再...
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數(shù)字人輕松學習Blender系列之九：升級了！BLENDER是一款開源邻眷、免費的多平臺眠屎、全能的三維動畫制作軟件。 Free to Use. Free to Change. Free to Share. Free to Se...
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新軟件，新趨勢驯镊，新人才葫督，新未來，新模式
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談論blender Vs Maya時板惑，請收起你的傲慢與偏見橄镜！關注這問題很久了，總覺得自己應該說點什么了洒放！13年的從業(yè)經(jīng)驗告訴我蛉鹿，不要再誤導初學者了...（此處廢話很多，不喜者繞道）本人從學習三維動畫技術到現(xiàn)在已經(jīng)整整13年了往湿，算起來也...
