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Nanopore 數(shù)據(jù)分析軟件tombo（三）Re-squiggle (Raw Signal Genomic Alignment)
The re-squiggle algorithm aligns raw signal (electric current nanopore measurements) to...
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10X單細胞（10X空間轉(zhuǎn)錄組）數(shù)據(jù)分析之細胞過濾那些事hello衰倦，大家好座云，今天已經(jīng)是五一假期的第二天疙赠，本人呢，哪也去不了朦拖，只好在家歇著圃阳，所以呢，給自己找點事做璧帝，本人93年捍岳，單身，現(xiàn)居天津武清睬隶，女孩子有沒有想談戀愛了锣夹，可以聯(lián)系我，...
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單細胞RunPCA()結(jié)果解讀+DimHeatmap的用法單細胞繪圖系列： Seurat繪圖函數(shù)總結(jié)[http://www.reibang.com/p/95e61f7e834d] 使用ggplot2優(yōu)化Seurat繪圖[https...
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單細胞轉(zhuǎn)錄調(diào)控分析-SCENIC1 簡介： 轉(zhuǎn)錄因子 (transcription factors, TFs) 是與特定DNA序列結(jié)合 (TFBS/motif) 滤蝠，調(diào)控DNA轉(zhuǎn)錄過程的一類蛋白質(zhì)。轉(zhuǎn)錄因子在...
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2023-09-13-SCENIC 踩坑全記錄-第一篇下載數(shù)據(jù)： 1. 網(wǎng)站地址: https://resources.aertslab.org/cistarget/databases/old/[https://resource...
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scRNA基礎(chǔ)分析-5：偽時間分析scRNA基礎(chǔ)分析-1:安裝包、導(dǎo)入數(shù)據(jù)蟹腾、過濾質(zhì)控 - 簡書 scRNA基礎(chǔ)分析-2：降維與聚類 - 簡書 scRNA基礎(chǔ)分析-3：鑒定細胞類型 - 簡書 scRNA基...
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plot1cell：優(yōu)雅的可視化你的單細胞數(shù)據(jù)簡介 plot1cell包提供了多種單細胞數(shù)據(jù)可視化的高級功能痕惋，可以基于Seurat分析結(jié)果對象直接進行可視化繪圖，主要依賴于Seurat V4娃殖，circlize值戳，Compl...
