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MUMMER 兩個基因組間比較MUMmer出現(xiàn)的歷史背景測序技術(shù)剛開始發(fā)展的時候，大家得到的序列都是單個基因的長度杰赛，所以一般都是逐個基因的比較呢簸，用的都是BLAST或FASTA通過逐個基因聯(lián)配的方式搜索數(shù)據(jù)...
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張紅祥辰晕，中國科學院植物研究所蛤迎。<br>交流，分享含友。
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序列比對軟件 MUMmer 結(jié)果文件解讀（三）該系列主要介紹了 MUMmer 軟件下核苷酸序列比對程序 nucmer 的使用替裆，計算操作見前兩篇推文校辩； 序列比對軟件 MUMmer 快速上手（一）[https://www.j...
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淺解NUMA機制導讀 本文適合知道NUMA這個詞但想進一步了解的新手。 以下的文章內(nèi)容包括：NUMA的產(chǎn)生背景辆童，NUMA的架構(gòu)細節(jié)和幾個上機演示的例子宜咒。 NUMA的誕生背景 在NUMA出現(xiàn)之...
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生物數(shù)據(jù)格式 - SAM/BAM格式 sam文件是短序列比對生成的文件，是二代測序中最核心的文件把鉴。在RNAseq故黑，變異檢測等分析中，都需要首先生成sam文件格式纸镊。bam文件是sam格式的二進制格式倍阐，轉(zhuǎn)換為二...
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5 分鐘入門 Google 最強NLP模型：BERTBERT (Bidirectional Encoder Representations from Transformers) 10月11日，Google AI Languag...
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轉(zhuǎn)錄組分析(1) - 基礎(chǔ)介紹轉(zhuǎn)錄組(transcriptome)岔冀，廣義上指某一生理條件下凯旭，細胞內(nèi)所有轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物的集合，包括信使RNA使套、核糖體RNA罐呼、轉(zhuǎn)運RNA及非編碼RNA；狹義上指所有mRNA的集合侦高。轉(zhuǎn)...
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中國科學院遺傳發(fā)育所 生物信息學博士<br>專注于基因組組裝和群體重測序研究
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GWAS全基因組關(guān)聯(lián)分析流程（BWA+samtools+gatk+Plink+Admixture+Tassel）
我梳理了GWAS全基因組關(guān)聯(lián)分析的整個流程奉呛，并提供了基本的命令计螺，用到的軟件包括BWA、samtools瞧壮、gatk登馒、Plink、Admixture咆槽、Tassel等陈轿，在此分享出來...
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個人博客: xuzhougeng.top (隨緣訪問)
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SAMtools: SAM格式的處理利器SAM及其相關(guān)工具 SAM格式介紹 SAM全稱是Sequence Alignment/Map, 是目前最常用的存放比對或聯(lián)配數(shù)據(jù)的格式麦射。無論是重測序，還是轉(zhuǎn)錄組灯谣，還是表觀組潜秋，...
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samtools的安裝和使用--------------- Nickier 2018-12-21 --------------- samtools是一個用于操作sam和bam文件的工具合集。能夠?qū)崿F(xiàn)二進...
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簡書太垃圾了揍愁，已經(jīng)棄用，改用語雀
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迷戀高質(zhì)量代碼的程序員，悟道者切距，熱愛分享朽缎，喜歡積極向上樂觀高效的生活。愿與更多志同道合者成為好友谜悟，分享交流话肖。
