生信阿拉丁，為實(shí)用而生
發(fā)簡信
IP屬地：江蘇
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MUMMER 兩個基因組間比較MUMmer出現(xiàn)的歷史背景測序技術(shù)剛開始發(fā)展的時(shí)候檀轨，大家得到的序列都是單個基因的長度，所以一般都是逐個基因的比較欺嗤，用的都是BLAST或FASTA通過逐個基因聯(lián)配的方式搜索數(shù)據(jù)...
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張紅祥筒溃，中國科學(xué)院植物研究所。<br>交流怜奖，分享浑测。
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序列比對軟件 MUMmer 結(jié)果文件解讀（三）該系列主要介紹了 MUMmer 軟件下核苷酸序列比對程序 nucmer 的使用歪玲，計(jì)算操作見前兩篇推文； 序列比對軟件 MUMmer 快速上手（一）[https://www.j...
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淺解NUMA機(jī)制導(dǎo)讀 本文適合知道NUMA這個詞但想進(jìn)一步了解的新手滥崩。 以下的文章內(nèi)容包括：NUMA的產(chǎn)生背景，NUMA的架構(gòu)細(xì)節(jié)和幾個上機(jī)演示的例子钙皮。 NUMA的誕生背景 在NUMA出現(xiàn)之...
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生物數(shù)據(jù)格式 - SAM/BAM格式 sam文件是短序列比對生成的文件，是二代測序中最核心的文件株灸。在RNAseq崇摄，變異檢測等分析中，都需要首先生成sam文件格式慌烧。bam文件是sam格式的二進(jìn)制格式，轉(zhuǎn)換為二...
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5 分鐘入門 Google 最強(qiáng)NLP模型：BERTBERT (Bidirectional Encoder Representations from Transformers) 10月11日屹蚊，Google AI Languag...
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轉(zhuǎn)錄組分析(1) - 基礎(chǔ)介紹轉(zhuǎn)錄組(transcriptome)，廣義上指某一生理?xiàng)l件下嘱兼，細(xì)胞內(nèi)所有轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物的集合国葬，包括信使RNA芹壕、核糖體RNA汇四、轉(zhuǎn)運(yùn)RNA及非編碼RNA；狹義上指所有mRNA的集合通孽。轉(zhuǎn)...
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中國科學(xué)院遺傳發(fā)育所 生物信息學(xué)博士<br>專注于基因組組裝和群體重測序研究
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GWAS全基因組關(guān)聯(lián)分析流程（BWA+samtools+gatk+Plink+Admixture+Tassel）
我梳理了GWAS全基因組關(guān)聯(lián)分析的整個流程互捌，并提供了基本的命令，用到的軟件包括BWA行剂、samtools、gatk硼讽、Plink巢价、Admixture、Tassel等固阁，在此分享出來...
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個人博客: xuzhougeng.top (隨緣訪問)
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SAMtools: SAM格式的處理利器SAM及其相關(guān)工具 SAM格式介紹 SAM全稱是Sequence Alignment/Map, 是目前最常用的存放比對或聯(lián)配數(shù)據(jù)的格式。無論是重測序并齐，還是轉(zhuǎn)錄組漏麦，還是表觀組，...
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samtools的安裝和使用--------------- Nickier 2018-12-21 --------------- samtools是一個用于操作sam和bam文件的工具合集撕贞。能夠?qū)崿F(xiàn)二進(jìn)...
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簡書太垃圾了，已經(jīng)棄用食侮，改用語雀
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迷戀高質(zhì)量代碼的程序員链快，悟道者，熱愛分享眉尸，喜歡積極向上樂觀高效的生活域蜗。愿與更多志同道合者成為好友，分享交流效五。
