一掌动、Metascape簡介 Metascape（http://metascape.org/[http://metascape.org/]） 是一個功能強大的基因功能注釋分析工...
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Metascape 專門為生物學者設計的基因富集分析網站
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重組質粒的構建（含引物設計）本文以白細胞介素6為例，介紹基因工程重組質粒構建的一般步驟。 1.準備 本文使用到的兩個軟件為Vector-NTI-Advance和snapgene： Vector-NTI-...
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SMART單細胞RNAseq測序原理陳魏學基因系列-單細胞RNAseq測序原理 視頻 總結 該方法有兩個特點：特殊的引物設計丛肮，采用MMLV作為逆轉錄酶 引物設計 引物設計的第二、三魄缚、四部分目的是：使引物正好結合...
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RPKM宝与、FPKM、TPM詳解
簡寫 RPKM: Reads Per Kilobase of exon model per Million mapped reads (每千個堿基的轉錄每百萬映射讀取的rea...
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Ribo-seq實驗總結
Ribosome profiling是一種新出現的實驗技術冶匹，它結合了高通量測序技術的應用习劫，可以在全基因組水平上監(jiān)測蛋白質的翻譯水平，給研究細胞內蛋白質的翻譯調控機制帶來了新的...
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關于Title：標題大小寫
（注：本文內容改編自LetPub） 標題有兩種基本樣式嚼隘。 1.“title case”诽里，即標題樣式：標題第一個、最后一個及所有主要單詞的首字母大寫飞蛹。 例如：Biochemic...
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TCGA / 癌癥簡稱 / 縮寫 / TCGA癌癥中英文對照
TCGA數據庫中含有的癌癥名稱焰宣，簡寫和中文名稱 Abbr英文名稱中文名稱ACCAdrenocortical carcinoma腎上腺皮質癌BLCABladder Urothe...
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下載TCGA基因表達量文件，應該選Count,FPKM還是FPKM-UQ ?GDC中轉錄組的表達量文件有3種類型捕仔，分別對應著不同的定量方法匕积。 Counts 就不用說了，來看看FPKM和FPKM-UQ有啥差別榜跌，這個可以查看GDC的官方說明文檔中的轉錄組...
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TCGA|GEO可視化分析第1篇---相關性分析導讀：今天有小伙伴問我闪唆，篩選完差異基因后，想看自己關注的基因和其他基因的關系斜做，應該怎么做苞氮？那當然要先做一下相關性分析了！好瓤逼，下面讓我給大家娓娓道來...... 正文： ste...
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GDC Data Transfer Tool 下載TCGA數據一霸旗、GDC Data Transfer Tool下載 GDC Data Transfer Tool是TCGA官方基于python開發(fā)的下載程序贷帮，在TCGA官網GDC部分可以找...
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TCGA學習03：生存分析TCGA學習01：數據下載與整理 - 簡書 [http://www.reibang.com/p/79816a20cbb1]TCGA學習02：差異分析 - 簡書 [htt...
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關于TCGA（癌癥基因組數據集）使用指南The cancer genome atlas(TCGA)數據庫儲存20多種癌癥的基因組數據，作為生信喵少不了要下載上面的數據來分析诱告。寫篇文章介紹一下撵枢，也加深自己的印象。 T...
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siRNA干擾實驗流程
前言 在研究某基因的功能時精居，常常要用到某基因的過表達锄禽，或敲除，或敲低靴姿。 在敲除方面沃但，常用的就是Crispir/Cas9技術，不過此技術周期比較長佛吓，步驟比較麻煩宵晚，就我們實驗室而...
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經驗總結：細胞轉染那些事兒
細胞轉染對初接觸細胞實驗的科研人員而言，是一道難過的坎兒维雇，細胞轉染率低的話淤刃，你珍貴的細胞可能就只能扔掉了。 大家都知道吱型，細胞是由帶負電荷的磷脂雙分子層構成逸贾，這對大分子物質來說...
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