一或粮、Metascape簡介 Metascape（http://metascape.org/[http://metascape.org/]） 是一個(gè)功能強(qiáng)大的基因功能注釋分析工...
發(fā)簡信
IP屬地：重慶
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Metascape 專門為生物學(xué)者設(shè)計(jì)的基因富集分析網(wǎng)站
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重組質(zhì)粒的構(gòu)建（含引物設(shè)計(jì)）本文以白細(xì)胞介素6為例，介紹基因工程重組質(zhì)粒構(gòu)建的一般步驟硝岗。 1.準(zhǔn)備 本文使用到的兩個(gè)軟件為Vector-NTI-Advance和snapgene： Vector-NTI-...
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SMART單細(xì)胞RNAseq測序原理陳魏學(xué)基因系列-單細(xì)胞RNAseq測序原理 視頻 總結(jié) 該方法有兩個(gè)特點(diǎn)：特殊的引物設(shè)計(jì)月幌，采用MMLV作為逆轉(zhuǎn)錄酶 引物設(shè)計(jì) 引物設(shè)計(jì)的第二悬蔽、三扯躺、四部分目的是：使引物正好結(jié)合...
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RPKM、FPKM伍派、TPM詳解
簡寫 RPKM: Reads Per Kilobase of exon model per Million mapped reads (每千個(gè)堿基的轉(zhuǎn)錄每百萬映射讀取的rea...
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Ribo-seq實(shí)驗(yàn)總結(jié)
Ribosome profiling是一種新出現(xiàn)的實(shí)驗(yàn)技術(shù)壁查，它結(jié)合了高通量測序技術(shù)的應(yīng)用，可以在全基因組水平上監(jiān)測蛋白質(zhì)的翻譯水平剔应，給研究細(xì)胞內(nèi)蛋白質(zhì)的翻譯調(diào)控機(jī)制帶來了新的...
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關(guān)于Title：標(biāo)題大小寫
（注：本文內(nèi)容改編自LetPub） 標(biāo)題有兩種基本樣式睡腿。 1.“title case”康谆，即標(biāo)題樣式：標(biāo)題第一個(gè)、最后一個(gè)及所有主要單詞的首字母大寫嫉到。 例如：Biochemic...
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TCGA / 癌癥簡稱 / 縮寫 / TCGA癌癥中英文對照
TCGA數(shù)據(jù)庫中含有的癌癥名稱，簡寫和中文名稱 Abbr英文名稱中文名稱ACCAdrenocortical carcinoma腎上腺皮質(zhì)癌BLCABladder Urothe...
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下載TCGA基因表達(dá)量文件细层，應(yīng)該選Count,FPKM還是FPKM-UQ ?GDC中轉(zhuǎn)錄組的表達(dá)量文件有3種類型惜辑，分別對應(yīng)著不同的定量方法。 Counts 就不用說了疫赎，來看看FPKM和FPKM-UQ有啥差別盛撑，這個(gè)可以查看GDC的官方說明文檔中的轉(zhuǎn)錄組...
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TCGA|GEO可視化分析第1篇---相關(guān)性分析導(dǎo)讀：今天有小伙伴問我，篩選完差異基因后捧搞，想看自己關(guān)注的基因和其他基因的關(guān)系抵卫，應(yīng)該怎么做？那當(dāng)然要先做一下相關(guān)性分析了胎撇！好介粘，下面讓我給大家娓娓道來...... 正文： ste...
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GDC Data Transfer Tool 下載TCGA數(shù)據(jù)一姻采、GDC Data Transfer Tool下載 GDC Data Transfer Tool是TCGA官方基于python開發(fā)的下載程序，在TCGA官網(wǎng)GDC部分可以找...
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TCGA學(xué)習(xí)03：生存分析TCGA學(xué)習(xí)01：數(shù)據(jù)下載與整理 - 簡書 [http://www.reibang.com/p/79816a20cbb1]TCGA學(xué)習(xí)02：差異分析 - 簡書 [htt...
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關(guān)于TCGA（癌癥基因組數(shù)據(jù)集）使用指南The cancer genome atlas(TCGA)數(shù)據(jù)庫儲(chǔ)存20多種癌癥的基因組數(shù)據(jù)爵憎，作為生信喵少不了要下載上面的數(shù)據(jù)來分析慨亲。寫篇文章介紹一下，也加深自己的印象宝鼓。 T...
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siRNA干擾實(shí)驗(yàn)流程
前言 在研究某基因的功能時(shí)刑棵，常常要用到某基因的過表達(dá)，或敲除席函，或敲低铐望。 在敲除方面冈涧，常用的就是Crispir/Cas9技術(shù)茂附，不過此技術(shù)周期比較長，步驟比較麻煩督弓，就我們實(shí)驗(yàn)室而...
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經(jīng)驗(yàn)總結(jié)：細(xì)胞轉(zhuǎn)染那些事兒
細(xì)胞轉(zhuǎn)染對初接觸細(xì)胞實(shí)驗(yàn)的科研人員而言营曼，是一道難過的坎兒，細(xì)胞轉(zhuǎn)染率低的話愚隧，你珍貴的細(xì)胞可能就只能扔掉了蒂阱。 大家都知道锻全，細(xì)胞是由帶負(fù)電荷的磷脂雙分子層構(gòu)成，這對大分子物質(zhì)來說...
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