一卫袒、Metascape簡(jiǎn)介 Metascape（http://metascape.org/[http://metascape.org/]） 是一個(gè)功能強(qiáng)大的基因功能注釋分析工...
發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：重慶
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Metascape 專(zhuān)門(mén)為生物學(xué)者設(shè)計(jì)的基因富集分析網(wǎng)站
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重組質(zhì)粒的構(gòu)建（含引物設(shè)計(jì)）本文以白細(xì)胞介素6為例嘹承，介紹基因工程重組質(zhì)粒構(gòu)建的一般步驟。 1.準(zhǔn)備 本文使用到的兩個(gè)軟件為Vector-NTI-Advance和snapgene： Vector-NTI-...
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SMART單細(xì)胞RNAseq測(cè)序原理陳魏學(xué)基因系列-單細(xì)胞RNAseq測(cè)序原理 視頻 總結(jié) 該方法有兩個(gè)特點(diǎn)：特殊的引物設(shè)計(jì)校读，采用MMLV作為逆轉(zhuǎn)錄酶 引物設(shè)計(jì) 引物設(shè)計(jì)的第二脖母、三户魏、四部分目的是：使引物正好結(jié)合...
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RPKM、FPKM呻征、TPM詳解
簡(jiǎn)寫(xiě) RPKM: Reads Per Kilobase of exon model per Million mapped reads (每千個(gè)堿基的轉(zhuǎn)錄每百萬(wàn)映射讀取的rea...
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Ribo-seq實(shí)驗(yàn)總結(jié)
Ribosome profiling是一種新出現(xiàn)的實(shí)驗(yàn)技術(shù)耘婚，它結(jié)合了高通量測(cè)序技術(shù)的應(yīng)用，可以在全基因組水平上監(jiān)測(cè)蛋白質(zhì)的翻譯水平陆赋，給研究細(xì)胞內(nèi)蛋白質(zhì)的翻譯調(diào)控機(jī)制帶來(lái)了新的...
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關(guān)于Title：標(biāo)題大小寫(xiě)
（注：本文內(nèi)容改編自LetPub） 標(biāo)題有兩種基本樣式沐祷。 1.“title case”嚷闭，即標(biāo)題樣式：標(biāo)題第一個(gè)、最后一個(gè)及所有主要單詞的首字母大寫(xiě)戈轿。 例如：Biochemic...
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TCGA / 癌癥簡(jiǎn)稱(chēng) / 縮寫(xiě) / TCGA癌癥中英文對(duì)照
TCGA數(shù)據(jù)庫(kù)中含有的癌癥名稱(chēng)，簡(jiǎn)寫(xiě)和中文名稱(chēng) Abbr英文名稱(chēng)中文名稱(chēng)ACCAdrenocortical carcinoma腎上腺皮質(zhì)癌BLCABladder Urothe...
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下載TCGA基因表達(dá)量文件色乾，應(yīng)該選Count,FPKM還是FPKM-UQ ?GDC中轉(zhuǎn)錄組的表達(dá)量文件有3種類(lèi)型誊册，分別對(duì)應(yīng)著不同的定量方法。 Counts 就不用說(shuō)了暖璧，來(lái)看看FPKM和FPKM-UQ有啥差別案怯，這個(gè)可以查看GDC的官方說(shuō)明文檔中的轉(zhuǎn)錄組...
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TCGA|GEO可視化分析第1篇---相關(guān)性分析導(dǎo)讀：今天有小伙伴問(wèn)我，篩選完差異基因后澎办，想看自己關(guān)注的基因和其他基因的關(guān)系嘲碱，應(yīng)該怎么做？那當(dāng)然要先做一下相關(guān)性分析了局蚀！好麦锯，下面讓我給大家娓娓道來(lái)...... 正文： ste...
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GDC Data Transfer Tool 下載TCGA數(shù)據(jù)一扶欣、GDC Data Transfer Tool下載 GDC Data Transfer Tool是TCGA官方基于python開(kāi)發(fā)的下載程序，在TCGA官網(wǎng)GDC部分可以找...
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TCGA學(xué)習(xí)03：生存分析TCGA學(xué)習(xí)01：數(shù)據(jù)下載與整理 - 簡(jiǎn)書(shū) [http://www.reibang.com/p/79816a20cbb1]TCGA學(xué)習(xí)02：差異分析 - 簡(jiǎn)書(shū) [htt...
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關(guān)于TCGA（癌癥基因組數(shù)據(jù)集）使用指南The cancer genome atlas(TCGA)數(shù)據(jù)庫(kù)儲(chǔ)存20多種癌癥的基因組數(shù)據(jù)千扶，作為生信喵少不了要下載上面的數(shù)據(jù)來(lái)分析料祠。寫(xiě)篇文章介紹一下，也加深自己的印象澎羞。 T...
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siRNA干擾實(shí)驗(yàn)流程
前言 在研究某基因的功能時(shí)髓绽，常常要用到某基因的過(guò)表達(dá)，或敲除妆绞，或敲低梧宫。 在敲除方面，常用的就是Crispir/Cas9技術(shù)摆碉，不過(guò)此技術(shù)周期比較長(zhǎng)，步驟比較麻煩脓豪，就我們實(shí)驗(yàn)室而...
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經(jīng)驗(yàn)總結(jié)：細(xì)胞轉(zhuǎn)染那些事兒
細(xì)胞轉(zhuǎn)染對(duì)初接觸細(xì)胞實(shí)驗(yàn)的科研人員而言巷帝，是一道難過(guò)的坎兒，細(xì)胞轉(zhuǎn)染率低的話扫夜，你珍貴的細(xì)胞可能就只能扔掉了楞泼。 大家都知道驰徊，細(xì)胞是由帶負(fù)電荷的磷脂雙分子層構(gòu)成，這對(duì)大分子物質(zhì)來(lái)說(shuō)...
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