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跟著Cell學(xué)單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組分析(七):細(xì)胞亞群分析及細(xì)胞互作
想獲取更多招拙，請至公眾號-KS科研分享與服務(wù)- 其實之前我們細(xì)胞的分群是很粗糙的唧瘾，只是一個大概的方向，隨著深入的研究别凤，需要對特定細(xì)胞的更多亞群進(jìn)行分析饰序，這里我們選擇免疫細(xì)胞進(jìn)行...
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scRNA-Seq | 單細(xì)胞亞群合并與提取本文涉及：亞群合并求豫，亞群提取，亞群細(xì)分诉稍，亞群抽樣 一般來講蝠嘉，不同亞群的細(xì)胞具有不同的功能，因此亞群分析對于研究十分重要杯巨，會影響后續(xù)分析結(jié)果蚤告。 進(jìn)行細(xì)胞亞群的分群的依據(jù)： 細(xì)胞...
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空間轉(zhuǎn)錄組第十講：空轉(zhuǎn)的細(xì)胞分化（擬時序分析）該怎么玩
在發(fā)育過程中仍源，細(xì)胞會對刺激做出反應(yīng)心褐，在整個生命過程中，從一種功能性“狀態(tài)”轉(zhuǎn)變?yōu)榱硪环N功能性“狀態(tài)”笼踩。擬時序分析（pseudo-time）逗爹，它指通過構(gòu)建細(xì)胞間的變化軌跡來重塑...
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單細(xì)胞數(shù)據(jù)分析筆記2-2: 細(xì)胞通訊分析（CellChat）3. CellChat CellChat桶至，用于根據(jù)單細(xì)胞數(shù)據(jù)對細(xì)胞間通信進(jìn)行推理、分析和可視化匾旭。包含文獻(xiàn)支持的多個物種中的配體-受體相互作用镣屹，從而全面概括已知的分子相互作用機(jī)...
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單細(xì)胞108篇文獻(xiàn)解讀之10---Inference and analysis of cell-cell communication using CellChat
大家好呀！今天為大家解讀的是一篇于2021年1月17日發(fā)表于nature communications的文章价涝，題目為Inference and analysis of cel...
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單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組及空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)習(xí)資源
(1). 單細(xì)胞上游軟件cellranger：單細(xì)胞上游軟件cellranger從頭說[http://www.reibang.com/p/9a09f7ad9d93] (2)...
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空間轉(zhuǎn)錄組第一講：10x空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)介紹
最近色瘩，空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究炙手可熱伪窖。細(xì)胞及其在組織樣本中的相對位置之間的關(guān)系對于理解疾病病理可能至關(guān)重要【诱祝空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)是一項開創(chuàng)性的技術(shù)覆山，它使科學(xué)家能夠測量組織樣本中的所有基因活...
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細(xì)胞通訊分析【二】——CellChat分析結(jié)果可視化本期內(nèi)容同步發(fā)布于單細(xì)胞天地微信公眾號。 回顧——細(xì)胞通訊網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建 前面的帖子中我們已經(jīng)成功地進(jìn)行了細(xì)胞間通訊網(wǎng)絡(luò)的構(gòu)建泥栖，總的來看借助下面簡易的分析流程即可完成： 今天繼續(xù)介...
