簡(jiǎn)要內(nèi)容--擬時(shí)序分析的定義--結(jié)果解讀--------做出結(jié)果(cluster比肄、state)--------確定起始點(diǎn)--------做start····end的圖(并且映...
想獲取更多掀亥,請(qǐng)至公眾號(hào)-KS科研分享與服務(wù)- 其實(shí)之前我們細(xì)胞的分群是很粗糙的,只是一個(gè)大概的方向妥色,隨著深入的研究铺浇,需要對(duì)特定細(xì)胞的更多亞群進(jìn)行分析,這里我們選擇免疫細(xì)胞進(jìn)行...
本文涉及:亞群合并丁稀,亞群提取,亞群細(xì)分倚聚,亞群抽樣 一般來(lái)講线衫,不同亞群的細(xì)胞具有不同的功能,因此亞群分析對(duì)于研究十分重要惑折,會(huì)影響后續(xù)分析結(jié)果授账。 進(jìn)行細(xì)胞亞群的分群的依據(jù): 細(xì)胞...
在發(fā)育過(guò)程中粗卜,細(xì)胞會(huì)對(duì)刺激做出反應(yīng)屋确,在整個(gè)生命過(guò)程中,從一種功能性“狀態(tài)”轉(zhuǎn)變?yōu)榱硪环N功能性“狀態(tài)”续扔。擬時(shí)序分析(pseudo-time)攻臀,它指通過(guò)構(gòu)建細(xì)胞間的變化軌跡來(lái)重塑...
3. CellChat CellChat刨啸,用于根據(jù)單細(xì)胞數(shù)據(jù)對(duì)細(xì)胞間通信進(jìn)行推理、分析和可視化识脆。包含文獻(xiàn)支持的多個(gè)物種中的配體-受體相互作用设联,從而全面概括已知的分子相互作用機(jī)...
大家好呀!今天為大家解讀的是一篇于2021年1月17日發(fā)表于nature communications的文章灼捂,題目為Inference and analysis of cel...
(1). 單細(xì)胞上游軟件cellranger:?jiǎn)渭?xì)胞上游軟件cellranger從頭說(shuō)[http://www.reibang.com/p/9a09f7ad9d93] (2)...
最近纵东,空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究炙手可熱粘招。細(xì)胞及其在組織樣本中的相對(duì)位置之間的關(guān)系對(duì)于理解疾病病理可能至關(guān)重要≠饲颍空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)是一項(xiàng)開(kāi)創(chuàng)性的技術(shù)洒扎,它使科學(xué)家能夠測(cè)量組織樣本中的所有基因活...
本期內(nèi)容同步發(fā)布于單細(xì)胞天地微信公眾號(hào)。 回顧——細(xì)胞通訊網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建 前面的帖子中我們已經(jīng)成功地進(jìn)行了細(xì)胞間通訊網(wǎng)絡(luò)的構(gòu)建衰絮,總的來(lái)看借助下面簡(jiǎn)易的分析流程即可完成: 今天繼續(xù)介...