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缺失值填充在數(shù)據(jù)分析領(lǐng)域的預(yù)處理過程繞不過去的一個坎邦鲫,蛋白質(zhì)組學(xué)也不例外,簡單記錄下神汹,可能有些地方有其特殊之處庆捺。 分析缺失值來源:完全隨機缺失(MCAR,如質(zhì)譜儀抖動屁魏,對數(shù)據(jù)...
前言 關(guān)于蛋白質(zhì)組學(xué)滔以,你是不是已經(jīng)聽了太多公司的宣講,介紹了一大堆的技術(shù)名詞氓拼,反而越聽越懵懂你画,腦袋一團亂麻?就和傳話游戲一樣桃漾,當(dāng)我們接收了多手信息以后坏匪,得到的信息就越不準(zhǔn)確。...
1. 簡介 X!Tandem是GPM:The Global Proteome Machine(主要基于Web的開源用戶界面撬统,用于分析和顯示蛋白質(zhì)鑒定數(shù)據(jù)适滓。關(guān)于GPM的更多內(nèi)容...
簡單收集一下全網(wǎng)的蛋白組學(xué)的分析 生信技能樹 1. 蛋白質(zhì)組學(xué)第1期-認識基礎(chǔ)概念[https://mp.weixin.qq.com/s/PBPqiX1Ks5EiS2HBG5...
0.輸入數(shù)據(jù)和R包 在生信星球公眾號聊天框回復(fù)“forest779”即可獲得輸入數(shù)據(jù)瞧柔。也可以自己根據(jù)表達矩陣與臨床信息生成睦裳,如下: 1.多因素cox回歸 建模就一句代碼造锅,出森...
1.問題起源 predict的參數(shù)type默認值就是“l(fā)p”,代表線性模型廉邑,理論上和大量文章里描述的公式應(yīng)該是結(jié)果相同的哥蔚。比如這個: https://www.ncbi.nlm...
需求 tpm、fpkm這樣的數(shù)據(jù)蛛蒙,計算公式里都有“基因有效長度”糙箍,有些地方直接叫基因長度。之前計算這些牵祟,都是采用最快的方式—找豆豆深夯。今天想要把這部分逐漸加到課程里,我就必須要...
1. 蛋白質(zhì)組學(xué)第1期-認識基礎(chǔ)概念 2. 蛋白質(zhì)組學(xué)第2期-認識蛋白質(zhì)組學(xué)原始數(shù)據(jù) 3. 蛋白質(zhì)組學(xué)第3期-蛋白質(zhì)組學(xué)的三大元素 4. 蛋白質(zhì)組學(xué)第4期-文章搜庫過程復(fù)現(xiàn) ...
作業(yè)中參考了:http://www.reibang.com/p/bc1fe435879c http://www.reibang.com/p/d10a85f21889 ht...
大家好质蕉,今天和大家分享的是19年1月份在J. Cell. Physiol(IF:4.522) 上的一篇文章,"Identification of the molecular ...
影響因子:6.2 從投稿到接收不到2個月 關(guān)于非腫瘤生信,我們也解讀過很多棒卷,主要有以下類型 1 單個疾病分析 2 單個疾病結(jié)合免疫浸潤顾孽,鐵死亡,自噬等相關(guān)分析 3 兩種相關(guān)疾...