作者，Evil Genius 看到最近的反饋，大家似乎對(duì)相親的事情很感興趣啊纽绍，??，但是大家別光顧笑啊铣揉，女孩子想想自己30多歲會(huì)不會(huì)也是這樣抄罕，男孩子30多了想想遇到這樣的女人該...
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Seurat官方教程|CITE-seq, RNA + ADT的WNN分析Compiled: March 18, 2021 原文鏈接：https://satijalab.org/seurat/articles/weighted_nearest_ne...
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團(tuán)隊(duì)作案HEK293洼专，史上最強(qiáng)搬磚細(xì)胞293細(xì)胞不是一個(gè)人在戰(zhàn)斗 對(duì)于做分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)的人來說，293細(xì)胞再熟悉不過了孵构。常在文獻(xiàn)中看到不同的293名字，全然沒考慮過293細(xì)胞原來還是團(tuán)隊(duì)作案烟很，分身無數(shù)颈墅。 293細(xì)...
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(Smartseq2) single cell RNA-seq分析練習(xí)這次跟著課程（Smartseq2 scRNA小鼠發(fā)育學(xué)習(xí)筆記-1-前言及上游介紹）要練習(xí)的文章是：Dissecting Cell Lineage Specification ...
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跟著Cell學(xué)單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組分析(十一):單細(xì)胞基因評(píng)分|AUCell評(píng)分
更多精彩請(qǐng)至我的公眾號(hào)《KS科研分享與服務(wù)》 第一次接觸基因評(píng)分是在一篇文章中，也不知道這樣的叫法對(duì)不對(duì)林说，作者選定了幾個(gè)炎癥基因煎殷，利用seurat包的一個(gè)打分函數(shù)AddMod...
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Seurat取子集時(shí)會(huì)用到的函數(shù)和方法在單細(xì)胞數(shù)據(jù)分析中，在確定細(xì)胞類型后腿箩，除了可以進(jìn)行差異表達(dá)基因分析外豪直，還可以針對(duì)單個(gè)細(xì)胞類型進(jìn)行分析特定分析，這時(shí)就需要我們提取細(xì)胞子集分開處理了珠移。 一弓乙、Seurat數(shù)據(jù)格式...
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scRNA-seq數(shù)據(jù)分析 || Monocle3同系列文章： sc-RAN-seq 數(shù)據(jù)分析||Seurat新版教程:Guided Clustering Tutorial[http://www.reibang.com/p...
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Monocle3：擬時(shí)序分析寫在前面：今天突然想寫這個(gè)教程，花了一下午看資料酪刀，其實(shí)我前面是有一些基礎(chǔ)的粹舵，但是看的還是會(huì)很亂，所以想把這個(gè)包的脈絡(luò)寫一下骂倘，希望能夠可以跟大家討論一下并且自己以后使用這個(gè)包的...
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【單細(xì)胞】scRNA-seq VS snRNA-seq題記：因?yàn)槲覀冊(cè)跍?zhǔn)備煙草某些部位單細(xì)胞樣品的時(shí)候历涝，質(zhì)量和活性總是比較低诅需，所以對(duì)于比較難制備的樣品，有的人推薦我們嘗試一下snRNA-seq荧库。就去了解了一下snRNA-seq堰塌。...
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免疫學(xué)筆記-1 | T細(xì)胞分化發(fā)育及其Marker1 關(guān)鍵細(xì)胞類型或Marker縮寫： 骨髓多能造血干細(xì)胞 HSC 淋巴樣祖細(xì)胞 lymphoid progenitor cell T細(xì)胞抗原識(shí)別受體 TCR 抗原提呈細(xì)胞 A...
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非Visium空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)Seurat分析流程本打工人跑過很多不同測序技術(shù)的空轉(zhuǎn)數(shù)據(jù)牵现，不同的測序技術(shù)平臺(tái)提供的分析方式也各有千秋，不過本人習(xí)慣了使用seurat邀桑，以下是總結(jié)的可以把其他空轉(zhuǎn)數(shù)據(jù)導(dǎo)入到seurat空轉(zhuǎn)流程中...
