@Alisa_1855 可以分享一下代碼嗎依鸥？
Transcriptional noise ratio（轉(zhuǎn)錄噪音比例）在一篇文章中困檩，在研究young和old 的小鼠的過程中，提到了old的樣本的轉(zhuǎn)錄噪音增加的問題蒿涎。這篇文章的名字是《An atlas of the aging lung map...
發(fā)簡信
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這個香農(nóng)熵應(yīng)用到基因表達(dá)上能說明什么呢瑰煎？
如何使用R計(jì)算香農(nóng)熵坷衍？
前言 1.1948 年注盈，香農(nóng)提出了“信息熵”(shāng)； 2.信息量的度量就等于不確定性的多少斋否。即：要搞懂一個非常非常不確定（gaoleng）的女孩（或是說我們一無所知的...
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@小王的笑 https://ftp.ebi.ac.uk/pub/databases/Rfam/CURRENT/ 在databse里找一找
Rfam:small-RNA注釋分類
Rfam是用來鑒定non-coding RNAs的數(shù)據(jù)庫梨水，常用于注釋新的核酸序列或者基因組序列。 infernal說明書:http://eddylab.org/inferna...
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@軟萌白甜Hedy icelogo
第8篇：用網(wǎng)頁版工具做功能分析和motif分析
上一篇介紹了使用ChIPseeker對peaks的分布和鄰近基因的注釋茵臭。除此之外疫诽，下游分析通常還包括鑒定我們感興趣的蛋白質(zhì)結(jié)合的motif；鑒定這些結(jié)合區(qū)域的基因以及這些基因...
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museuploader_linux.py在哪里能下載到啊
超高速 | 使用 MuseTransfers 進(jìn)行文件傳輸
1. 扯淡時間[#%E6%89%AF%E6%B7%A1%E6%97%B6%E9%97%B4] 在追求高效的今天旦委，會發(fā)現(xiàn)數(shù)據(jù)傳輸時常存在不高效的狀態(tài)奇徒，如下圖說明：你有A、B兩臺...
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【已解決】Xshell評估期已過缨硝，xshell7個人免費(fèi)版下載Xshell功能強(qiáng)大摩钙，在使用過程中，本人習(xí)慣它的黑底風(fēng)格查辩，所以一直用的Xshell腺律，雖然好用奕短，但很多人的xshell是在軟件管家里下載的宜肉，或是不知道哪里有免費(fèi)的匀钧，所以下載到了...
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想不到有一天會自己抄自己。
一行代碼解決GO富集分析柱形圖
David Kobas 富集分析的結(jié)果怎么轉(zhuǎn)變?yōu)榘l(fā)表級別的圖片谬返？示例數(shù)據(jù)直接從網(wǎng)站導(dǎo)出整理成如下這種格式讀入R
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跟chip的流程沒什么區(qū)別嗎
MeRIP-Seq流程
MeRIP-Seq流程圖如下： 1 數(shù)據(jù)下載 注意事項(xiàng)：Aspera不能在root權(quán)限下安裝之斯，必須新增加一個普通用戶才安裝，一般安裝在/home/user/下遣铝，安裝完成后將下...
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@caokai001 完全沒毛病??
雅卡爾指數(shù) (Jaccard index)
雅卡爾指數(shù)佑刷，或者稱為交并比、雅卡爾相似系數(shù)酿炸，可以用于比較樣本集的相似性與多樣性瘫絮。其定義為兩個集合交集大小與并集大小之間的比例： 雅卡爾距離（Jaccard distance）...
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挺厲害的 比我優(yōu)秀好多 ?? 突然感覺自己七年白上了??
我的大學(xué)（下）
信息管理1501 在大四的下學(xué)期，我在QQ郵箱實(shí)習(xí)填硕。同組里也有一個來自我們學(xué)院的實(shí)習(xí)生麦萤。有一次我們偶爾閑聊的時候，聊到四年來的學(xué)習(xí)生活扁眯。他感慨了一句：“我覺得你們信管很厲害壮莹，...
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@dicklim 解決掉了 感謝
200918 Circ之旅4.2-CIRIquant
Kevinzjy/ CIRIquant[https://github.com/Kevinzjy/CIRIquant]CIRIquant-cookbook[https://ci...
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config.yml 具體要什么格式寫啊 我照著他的說明書寫頻繁報(bào)錯
200918 Circ之旅4.2-CIRIquant
Kevinzjy/ CIRIquant[https://github.com/Kevinzjy/CIRIquant]CIRIquant-cookbook[https://ci...
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合并之后 junction reads里的那些NA怎么處理啊
子宮內(nèi)膜癌circRNA數(shù)據(jù)分析（重分析）
項(xiàng)目目的 CIRI2和CIRCexplore,2聯(lián)合使用對數(shù)據(jù)進(jìn)行circRNAs鑒定，并進(jìn)一步做下游的差異表達(dá)等分析姻檀。 項(xiàng)目流程 1·tophat命满，BWA用于map到參考基...
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我也得到了這樣一張只有一條非常淺色的線的圖 看其他的正常的結(jié)果中間都挺飽滿的啊 這個是由什么原因造成的啊? 分辨率的問題?
HiCPlotter
ref：https://github.com/kcakdemir/HiCPlotter py2.7 python /media/shen/*/sun/biosoft/HiCP...
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ChIP-seq實(shí)踐(H3K27Ac,enhancer的篩選和enhancer相關(guān)基因的GO分析)
在實(shí)踐之前，我先查找了一下有關(guān)組蛋白修飾的知識點(diǎn)：（參考文章：http://www.reibang.com/p/8aca72809c5c） 組蛋白修飾能預(yù)測染色質(zhì)的類型（異...
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有沒有什么途徑能預(yù)測superenhancer呢
ChIP-seq實(shí)踐(H3K27Ac,enhancer的篩選和enhancer相關(guān)基因的GO分析)
在實(shí)踐之前绣版，我先查找了一下有關(guān)組蛋白修飾的知識點(diǎn)：（參考文章：http://www.reibang.com/p/8aca72809c5c） 組蛋白修飾能預(yù)測染色質(zhì)的類型（異...
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LTR ERV的信息要在哪里找啊
「文獻(xiàn)06」植入前胚胎的染色質(zhì)可及性和轉(zhuǎn)錄組圖譜
日期：2019年2月9日——2019-Week6分類：「思路,方法」題目：An integrated chromatin accessibility and transcri...
