寫在前面的話 你既然點進來了糖荒，說明你多半用過這個軟件刘离。但我猜罪郊，大多數(shù)人早期使用這個軟件的時候，一定是趕鴨子上架：因為要畫圖蓬坡，所以必須會。 但你真的懂了么？ 太長不看系列 對于...
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你考慮過computeMatrix的工作原理么? -
R數(shù)據(jù)可視化12:曼哈頓圖曼哈頓圖的名字來源是因為其形如曼哈頓的天際線：高聳在較低高度的“建筑物”上方的摩天大樓的輪廓腮鞍。主要用于GWAS結(jié)果的展示，今天讓我們來看看如何繪制曼哈頓圖莹菱。 什么是曼哈頓圖 ...
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生信筆記5-GWAS與eQTL引言 GWAS與eQTL都是用于研究基因位點與表型之間關(guān)系的手段移国，彼此之間存在很多的區(qū)別與聯(lián)系。 GWAS 全基因組關(guān)聯(lián)分析（Genome Wide Association ...
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空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫匯總作者道伟，Evil Genius 分享一個數(shù)據(jù)庫迹缀，CROST, CROST應(yīng)用標準化處理流程整合了182個高質(zhì)量的空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)集，涵蓋8個不同物種、35種組織類型和56種疾病的...
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免疫學(xué)筆記-1 | T細胞分化發(fā)育及其Marker1 關(guān)鍵細胞類型或Marker縮寫： 骨髓多能造血干細胞 HSC 淋巴樣祖細胞 lymphoid progenitor cell T細胞抗原識別受體 TCR 抗原提呈細胞 A...
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日拱一卒，功不唐捐??更多內(nèi)容<a href="https://links.jianshu.com/go?to=https%3A%2F%2Fwww.yuque.com%2Fbooks%2Fshare%2F24352a21-d357-4bd2-b211-fbc801f0cb79%3F%23" target="_blank">https://www.yuque.com/books/share/24352a21-d357-4bd2-b211-fbc801f0cb79?#</a> 《大魚的生信筆記》
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單細胞PBMC經(jīng)典細胞類型marker背marker list 不要貪多哦嫂易，要慢慢地背兄朋，一個一個一個地背，然后背了再很快地忘記怜械，如此反復(fù)颅和。 外周血單個核細胞（Peripheral blood mononucle...
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Seurat取子集時會用到的函數(shù)和方法在單細胞數(shù)據(jù)分析中，在確定細胞類型后缕允，除了可以進行差異表達基因分析外峡扩，還可以針對單個細胞類型進行分析特定分析，這時就需要我們提取細胞子集分開處理了障本。 一教届、Seurat數(shù)據(jù)格式...
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單細胞轉(zhuǎn)錄組/AverageExpression平均表達是個啥
AverageExpression gzh：BBio Seurat中用于計算cluster基因平均表達值的函數(shù)，為啥這個結(jié)果和FindMarkers中差異倍數(shù)avg_logF...
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python學(xué)習(xí)
pip install seaborn -i http://pypi.douban.com/simple/ --trusted-host pypi.douban.com se...
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Cell Metabolism | Biological age is increased by stress and restored upon recovery
生物學(xué)年齡（Biological Age）：DNA甲基化時鐘觀察和評估基因組中各個位點的甲基化水平隨年齡增長而發(fā)生的變化驾霜，從而評估其生物學(xué)年齡案训。 DNA甲基化時鐘：維持DNA...
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文獻閱讀-《Tutorial: guidelines for the computational analysis of single-cell RNA sequencing data》文獻名稱：教程：單細胞 RNA 測序數(shù)據(jù)的計算分析指南文獻期刊：nature protocols發(fā)表時間：2021-1-9 摘要 單細胞 RNA 測序技術(shù) (scRNA-se...
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CellDancer細胞不會跳舞我不知道强霎，但似乎nature biotech的文章代碼會有毒。蓉冈。城舞。 CellDancer是最新發(fā)表在nature biotechnology上的一個類似scVel...
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領(lǐng)域人物
Steve Horvath：https://horvath.genetics.ucla.edu/ 開發(fā)了WGCNA 開發(fā)基于表觀遺傳學(xué)的衡量衰老的時鐘
