傳說中的 “bio生物信息” 首席編輯
發(fā)簡信
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文獻學(xué)習(xí)037--[sc/sn]人類心臟單細胞圖譜20年9月24日發(fā)表在nature上的文章，該研究由哈佛醫(yī)學(xué)院、劍橋大學(xué)和帝國理工學(xué)院等機構(gòu)的科學(xué)家共同進行。該研究是人類細胞圖譜計劃（Human Cell Atlas）的一...
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文獻學(xué)習(xí)048--[sc]Cross-tissue organization of the fibroblast lineage成纖維細胞由功能不同的細胞群體組成秃殉，這些群體根據(jù)其來源的組織和與之相關(guān)的疾病而不同。此外浸剩，即使在一個組織中钾军，也不是所有的成纖維細胞都是一樣的。離散的绢要、不重疊的成纖維細胞亞型驅(qū)...
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scRNAseq雙細胞去除-1: DoubletFinder10x平臺的雙細胞率（符合泊松分布1）： 根據(jù)Poisson分布吏恭，單個液滴包含超過一個細胞（doublets或multiplets）的頻率隨著上機細胞的濃度而改變。通常如果上...
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DoubletFinder
相信各位做單細胞的童鞋們重罪，都遇到過去除多細胞的情況樱哼，而Cellranger默認的是前1%（3000cell），對于低質(zhì)量的細胞有了算法來確認是否保留剿配，但是對于多細胞而言搅幅，Ce...
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文獻學(xué)習(xí)110-宮頸鱗狀細胞癌多組學(xué)分析鑒定具有生物學(xué)和臨床意義的cellular ecosystems宮頸癌是女性癌癥死亡的第四大原因，其中宮頸鱗狀細胞癌（CSCC）是最常見的類型惨篱。不幸的是盏筐，晚期围俘、轉(zhuǎn)移性或復(fù)發(fā)性CSCC的5年生存率僅為16.5%砸讳。盡管免疫檢查點阻斷(ICB)...
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python代碼小知識之盡量不使用os.system（）
hello满败，大家好肤频，分享一個python代碼小知識，如果我們使用的是linux環(huán)境算墨，在使用python代碼調(diào)用linux命令的時候宵荒，通常的做法就是os.system（）,當(dāng)然...
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專注WGBS Chipseq等數(shù)據(jù)分析<br>perl python R腳本編輯處理數(shù)據(jù)
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單細胞個性化分析之細胞注釋篇作者骇扇，追風(fēng)少年i 當(dāng)單細胞基礎(chǔ)分析已經(jīng)完善的時候，擺在眼前首要的問題就是面粮，每個cluster具體是細胞細胞類型少孝？只有在注釋了每個群的基礎(chǔ)上，才可以進行下游更加深入的個性化分析...
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單細胞數(shù)據(jù)分析之蛋白活性推斷篇作者鸿脓，Evil Genius 世事無常 315打假日 2月26日獲知家里電信詐騙抑钟，到今日過去了17天，從一開始的震驚野哭，到冷靜也僅用了3天在塔， 我特別感謝那些幫助了我的人，很多...
