ggsave保存ggplot畫圖的文件
發(fā)簡信
IP屬地：上海
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簡短介紹下如何用GCE確定GWAS閾值
GWAS大家都很熟悉了沪蓬，隨著目前越來越多的重測序文章的發(fā)表，可見如今SNP數(shù)據(jù)是非常的豐富，以及GWAS也發(fā)展了15年了幻件，如今到了一個后GWAS時代。GWAS我也做了很多了蛔溃，...
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轉(zhuǎn)座子（TE,散在重復(fù)）特征及其對基因組影響轉(zhuǎn)自:http://www.reibang.com/p/fd2b417ceff8[http://www.reibang.com/p/fd2b417ceff8] 基因組中重...
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轉(zhuǎn)座子對基因調(diào)控的作用本篇為轉(zhuǎn)載绰沥，原創(chuàng)作者為AI寫代碼的DNA 義冠轉(zhuǎn)座元件對基因調(diào)控的作用[https://mp.weixin.qq.com/s/PXxkXJf3IORul_9Si24__w]...
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VCF(variant call format)文件格式詳解vcf格式是做變異(variant)分析的時候最常見的一種格式，主要包括一些header和位點(diǎn)的信息贺待』涨可以參考這個說明文檔學(xué)習(xí)：https://www.internation...
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如何從vcf文件中批量提取一系列基因的SNP位點(diǎn)？
需求 客戶的一個簡單需求： 我有一批功能基因位點(diǎn)麸塞，想從重測序的群體材料中找到這些位點(diǎn)秃臣，如何批量快速獲得？ 示例文件 gene.txt test.vcf 代碼實(shí)現(xiàn) run.sh...
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富集分析（超幾何分布）（Fisher's Exact Test）
1. 簡介 超幾何分布（hypergeometric）是統(tǒng)計(jì)學(xué)上一種離散概率分布。它描述了由有限個物件中抽出n個物件祥绞，成功抽出指定種類的物件的個數(shù)（不歸還）非洲。 超幾何分布和F...
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patchwork：ggplot拼圖下面實(shí)例搬運(yùn)自patchwork官網(wǎng)：https://patchwork.data-imaginist.com/articles/patchwork.html[https:/...
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公眾號 R語言數(shù)據(jù)分析指南兜喻，歡迎大家關(guān)注
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Linux Parallel 簡單用法
parallel是一個Linux命令行并行工具(mac也可以用) 1.安裝 2. 用法 這里只說一種簡單的用法，基本上能滿足日常工作需求,假設(shè)當(dāng)前目錄有三個 *.txt 文件...
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聊聊“基因組共線性”最近看了幾篇關(guān)于共線性分析的微信/簡書推送钾怔，發(fā)現(xiàn)不少研究人員把“編碼基因共線性”錯誤地描述為“全基因組共線性”碱呼。這是兩個完全不同的概念，前者主要是基于蛋白水平宗侦，蛋白的保守性很...
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轉(zhuǎn)座子(TE)來源的植物lncRNAlncRNA 70% 的人類基因組能夠被轉(zhuǎn)錄愚臀，而其中僅有 1% ～ 2% 的轉(zhuǎn)錄本能夠編碼蛋白，余下 98% 均為非編碼RNA(non-coding RNA矾利，ncRNA)姑裂。在...
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R語言接受命令行參數(shù)的三種方式
R語言接受命令行參數(shù)的三種方式 最近要用一下R的命令行，但是發(fā)現(xiàn)命令行參數(shù)不是很友好梦皮，就總結(jié)了一下目前常用的R的命令行參數(shù)的接受方法炭分。 平常我們使用R語言的時候常常都是在交互...
