非常實(shí)用
探針注釋之其他基因id轉(zhuǎn)換0.介紹一下find_anno 我搞了一個函數(shù)，名叫find_anno娜膘，可以根據(jù)GPL平臺編號給出探針注釋的代碼 第一種情況是有兩個代碼可以用 例如 給出的紅色字里面就有代碼...
IP屬地：廣東
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探針注釋之其他基因id轉(zhuǎn)換0.介紹一下find_anno 我搞了一個函數(shù)腕够，名叫find_anno级乍，可以根據(jù)GPL平臺編號給出探針注釋的代碼 第一種情況是有兩個代碼可以用 例如 給出的紅色字里面就有代碼...
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通過GSVA與相關(guān)性分析尋找目的基因的相關(guān)通路
最近幫師弟做一個GSVA分析玫荣，發(fā)現(xiàn)已經(jīng)忘的差不多了，順便整理一下吧大诸。 基因集變異分析（Gene Set Variation Analysis, GSVA）可以將一個基因表達(dá)矩...
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WGCNA（3）：基因模塊與性狀關(guān)聯(lián)識別重要基因前面的文章中完成了數(shù)據(jù)導(dǎo)入和網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建捅厂，下面是將基因模塊與性狀進(jìn)行關(guān)聯(lián)贯卦，從而識別與表型相關(guān)的重要基因。WGCNA（1）：R包安裝及數(shù)據(jù)導(dǎo)入清洗 - 簡書 (jianshu.co...
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單細(xì)胞之富集分析-2：批量GSEA和GSVA分析單細(xì)胞富集分析系列： 單細(xì)胞之富集分析-1：單細(xì)胞GSEA分析流程[http://www.reibang.com/p/00f069cb239c] 1. 背景 Gene Se...
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10X單細(xì)胞（10X空間轉(zhuǎn)錄組）數(shù)據(jù)分析之細(xì)胞過濾那些事hello焙贷，大家好撵割，今天已經(jīng)是五一假期的第二天，本人呢辙芍，哪也去不了啡彬，只好在家歇著，所以呢故硅，給自己找點(diǎn)事做庶灿，本人93年，單身吃衅，現(xiàn)居天津武清往踢，女孩子有沒有想談戀愛了，可以聯(lián)系我徘层，...
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單細(xì)胞數(shù)據(jù)中到底應(yīng)該如何處理線粒體基因
什么是線粒體基因 線粒體是參與細(xì)胞凋亡啟動和執(zhí)行的主要細(xì)胞器之一峻呕。線粒體基因在大多數(shù)細(xì)胞中表達(dá)，其表達(dá)水平是細(xì)胞類型特異性的趣效。也就是說這個也是和細(xì)胞類型及其狀態(tài)有關(guān)系的瘦癌。 為...
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非生信人員做單細(xì)胞數(shù)據(jù)分析的入門秘籍寫在前面 自2009年第一篇單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組文章發(fā)表以來，經(jīng)過十多年的發(fā)展英支，各研究機(jī)構(gòu)和生物公司相繼推出單細(xì)胞RNA測序(scRNA-seq)服務(wù)佩憾，這使得單細(xì)胞測序已經(jīng)從“王謝堂...
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學(xué)到很多哮伟，后面是不是還有一個單細(xì)胞WGCNA（2）干花，很期待
單細(xì)胞WGCNA分析(1)
我在前面也分享過幾篇關(guān)于WGCNA的帖子，其實(shí)WGCNA本身就是對基因進(jìn)行了加權(quán)共表達(dá)楞黄，合理分組的結(jié)果池凄。 如果對于一個表達(dá)量矩陣，本身就至于2個分組鬼廓，WT和處理肿仑，那么簡單的差...
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單細(xì)胞WGCNA分析(1)我在前面也分享過幾篇關(guān)于WGCNA的帖子尤慰，其實(shí)WGCNA本身就是對基因進(jìn)行了加權(quán)共表達(dá)，合理分組的結(jié)果雷蹂。 如果對于一個表達(dá)量矩陣伟端，本身就至于2個分組，WT和處理匪煌，那么簡單的差...
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單細(xì)胞測序——髓系細(xì)胞注釋marker主要根據(jù)文獻(xiàn)中的描述與方法 髓系細(xì)胞分類 巨噬細(xì)胞，單核細(xì)胞霜医，DC細(xì)胞 文獻(xiàn)一：Single-cell landscape of the ecosystem in early...
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免疫細(xì)胞注釋-2：髓系細(xì)胞scRNAseq免疫細(xì)胞注釋： 免疫細(xì)胞注釋-1：T細(xì)胞[http://www.reibang.com/p/0127c9b380c9] 免疫細(xì)胞注釋-2：髓系細(xì)胞[http...
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免疫細(xì)胞注釋-1：T細(xì)胞scRNAseq免疫細(xì)胞注釋： 免疫細(xì)胞注釋-1：T細(xì)胞[http://www.reibang.com/p/0127c9b380c9] 免疫細(xì)胞注釋-2：髓系細(xì)胞[http...
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10+SCI齿拂，生信分析篩選基因+實(shí)驗驗證，可以作為模板文章學(xué)習(xí)肴敛！生信小課堂 大家好署海！今天給大家介紹一篇2023年1月發(fā)表在International Journal of Biological Sciences（IF=10.75）雜志上，...
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