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大神朱灿，求：R腳本傳參批量投遞腳本得到RDS呀 十分感謝
結(jié)合Seurat批量去雙胞（DoubletFinder）2022-05-18
使用背景 我們一般拿到單細(xì)胞矩陣需要做的一個(gè)預(yù)處理步驟是去雙胞，而常用的一個(gè)R包是DoubletFinder[https://github.com/chris-mcginni...
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收集一些生物信息學(xué)的分析流程的文章宠页。感謝這些簡友整理的生信分析流程！ 如果簡友投稿沒有被我收入專題寇仓，可能是我沒看到或者收入到其他針對性更強(qiáng)的專題中了举户。望見諒！ ???????????????????????? 文章的收錄是有順序的遍烦，查看的時(shí)候請點(diǎn)擊“最新收錄”然后進(jìn)行查看俭嘁。 ?? 全基因組測序(WGS)分析 ?? 轉(zhuǎn)錄組分析RNA-seq的分析流程 ?? 染色質(zhì)免疫共沉淀技術(shù)ATAC-Seq、ChIP-Seq分析 ?? 單細(xì)胞scRNA-seq分析 ?? 癌癥的預(yù)后標(biāo)志物查找 ?? 系統(tǒng)發(fā)育演化進(jìn)化樹構(gòu)建與分析 ?? 群體遺傳學(xué)分析 ?? 全基因組關(guān)聯(lián)分析(GWAS) ?? 基因家族的分析 ?? 甲基化測序與分析 ?? KEGG/GO功能富集分析 ?? 圖形繪制具體細(xì)節(jié)的比如熱圖服猪、曼哈頓圖的繪制等 ?? python供填、perl、R的包的使用過程 ?? 具體工具的使用蔓姚，比如GATK的使用過程 ?? 數(shù)據(jù)庫的挖掘方法捕虽，比如TCGA數(shù)據(jù)庫的使用 ?? 另外就是整個(gè)文章走下來的流程 ?? ?? ??
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您好，請問wgbs的話計(jì)算區(qū)域甲基化水平坡脐，有什么軟件嗎泄私？
甲基化水平計(jì)算方法
一、單個(gè)位點(diǎn)甲基化水平： 單個(gè)位點(diǎn)的甲基化水平＝支持甲基化C的reads數(shù)/總的reads數(shù) 對于參考基因組上的C位點(diǎn)备闲，有些reads（reads上此位置處是C）支持此位點(diǎn)是...
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您好 想請教一下 這個(gè)代碼在Linux上執(zhí)行python *.py時(shí)梧奢，后面輸入輸出怎么寫? 還是在代碼里改，才接觸演痒。謝謝您
使用DSS做差異甲基化區(qū)域（DMR分析）
DSS是一個(gè)可用于做RNA-seq差異表達(dá)分析或甲基化差異分析的R包亲轨，在做差異甲基化分析時(shí)，DSS對每個(gè)CpG進(jìn)行統(tǒng)計(jì)檢驗(yàn)鸟顺，然后根據(jù)我們指定的閾值可以篩選出差異甲基化位點(diǎn)（d...
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表觀遺傳學(xué)忠實(shí)粉莉掂，不定時(shí)更新科普文獻(xiàn)，歡迎關(guān)注一起交流～
